Lihat sumber Deinococcus radiodurans

[[File:Deinococcus_radiodurans.jpg|thumb|right|280px|Deinococcus radiodurans]]

'''''Deinococcus radiodurans''''' adalah salah satu bakteri kelompok ekstremofil (dapat hidup di suasana ekstrem) dengan karakteristik utama berupa ketahanan terhadap efek [[mutasi|mutagenik]] dan mematikan dari berbagai agen perusak [[DNA]], seperti paparan [[radiasi]] [[ion]] (''ionizing radiation'').<ref>Harris DR. ''The Stable, Functional Core of DdrA from ''Deinococcus radiodurans'' R1 Does Not Restore Radioresistance In Vivo''. ''J Bacteriol''. 2008. Vol. 190 (19). hlm. 6475-6482. doi:10.1128/JB.01165-07.</ref><ref>Battista JR. ''Against all odds: the survival strategies of ''Deinococcus radiodurans''''. ''Ann Rev Microbiol''. 1997. Vol. 51. hlm. 203-224. doi:10.1146/annurev.micro.51.1.203.</ref>

[[Organisme]] ini masih dapat hidup dalam paparan [[radiasi]] berkali-kali lipat dari jumlah yang umumnya sudah membunuh organisme lain.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 43.</ref> [[Kromosom]] ''D. radiodurans'' bahkan dapat terbentuk kembali setelah hancur akibat radiasi.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 43.</ref> Oleh karena itu, ''D. radiodurans'' adalah organisme paling toleran terhadap kerusakan DNA yang pernah diidentifikasi.<ref>Battista JR. ''Against all odds: the survival strategies of ''Deinococcus radiodurans''''. ''Ann Rev Microbiol''. 1997. Vol. 51. hlm. 203-224. doi:10.1146/annurev.micro.51.1.203.</ref>

== Sejarah penemuan dan klasifikasi ==
''D. radiodurans'' pertama kali dideteksi oleh Anderson ''et al.'' pada tahun [[1956]] di dalam [[daging]] kalengan yang disterilisasi dengan radiasi [[sinar X]] dan yang tidak diradiasi.<ref>Anderson AW. ''Studies on a radio-resistant micrococcus. I. Isolation, morphology, cultural characteristics, and resistance to gamma radiation''. ''Food Technol''. 1956. Vol. 1. hlm. 575-578.</ref> Hebatnya, meski telah disterilisasi tetapi tetap terjadi pembusukan pada daging sehingga disimpulkan ada aktivitas [[mikroorganisme]] di dalamnya.<ref>Anderson AW. ''Studies on a radio-resistant micrococcus. I. Isolation, morphology, cultural characteristics, and resistance to gamma radiation''. ''Food Technol''. 1956. Vol. 1. hlm. 575-578.</ref> ''D. radiodurans'' sebelumnya dimasukan ke dalam [[genus]] ''Micrococcus''.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Namun penelitian pertama kali oleh Feltham menunjukkan bahwa bakteri yang disebut ''M. radiodurans'' dan kerabatnya itu berbeda dengan [[spesies]] ''Micrococcus'' yang sudah diketahui.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Brooks ''et al.'' pada tahun [[1980]] berhasil menunjukkan adanya perbedaan dengan [[genus]] ''Micrococcus'' berdasarkan uji terhadap sekuen [[gen]] penyandi 16S rRNA spesies tersebut.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Selain sekuen gen, bukti diperkuat dengan hasil analisis terhadap homologi DNA, komposisi [[asam lemak]], dan [[dinding sel]] beserta komposisinya.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Pada tahun 1981, Brooks dan Murray mengajukan penggantian nama spesies yang dimaksud menjadi ''Deinococcus radiodurans''.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Berdasarkan [[etimologi]]nya nama spesies ''D. radiodurans'' berasal dari [[bahasa Latin]].<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> ''Deinos'' (adj): aneh atau tidak biasa, ''coccus'' (n): semacam biji [[gandum]] atau buah beri, ''radioatio'' (adj): radiasi, dan ''durans''(adj): pertahanan sehingga ''Deinococcus'' berarti [[kokus]] yang tidak biasa dan ''radiodurans'' berarti menahan radiasi.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Brooks dalam [[jurnal]] ''[[International Journal of Systematic Bacteriology]]'' menginginkan untuk mempertahankan nama penunjuk spesies ''radiodurans'' karena dirasa memiliki asosiasi yang tepat dengan organisme tersebut, yaitu tahan terhadap radiasi tinggi.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref>

== Morfologi dan fisiologi ==
''D. radiodurans'' berbentuk bulat ([[kokus]]) dengan [[diameter]] 1.5-3&nbsp;µm dan tumbuh sebagai [[sel]] tunggal atau berbentuk tetrad.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> [[Bakteri]] ini tergolong [[Gram positif]], tetapi memiliki membran luar seperti [[bakteri]] [[Gram negatif]].<ref>Elstov M. ''Fine structure of the ''Deinococcus radiodurans'' nucleoid revealed by cryoelectron microscopy of vitreous sections''. ''J Bacteriol''. 2005. Vol. 187 (23). hlm. 8074-8054. doi:10.1128/JB.187.23.8047–8054.2005.</ref><ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref>
Hanya saja, membran luar ''D. radiodurans'' tidak memiliki [[lipid]] A.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Bakteri ini tidak membentuk [[spora]] dan bersifat non [[motil]].<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Koloni berwarna [[merah]] bila ditumbuhkan di media [[agar]] karena memiliki kandungan [[pigmen]] [[karotenoid]].<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Koloni berbentuk cembung dengan permukaan halus.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> ''D. radiodurans'' adalah bakteri [[aerob]] dengan suhu optimum pertumbuhan 30&nbsp;°C.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Semua galur bakteri ini dapat tumbuh dengan kadar [[garam]] 1% dan kebanyakan galur tumbuh pada kadar garam 5%.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Bakteri ini tergolong kemoorganotrof yang artinya menggunakan nutrisi dari senyawa [[kimia]] organik.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref> Berdasarkan uji [[biokimia]], ''D. radiodurans'' dapat mem[[fermentasi]] [[glukosa]] dan [[fruktosa]] sehingga menghasilkan [[asam]], sedangkan [[gliserol]] dan manosa dapat digunakan tetapi tidak menghasilkan asam.<ref>Brooks BW. [http://ijs.sgmjournals.org/cgi/reprint/31/3/353 Nomenclature for ''"Micrococcus radiodurans”'' and other radiation-resistant cocci: ''Deinococcaceae'' fam. nov. and ''Deinococcus'' gen. nov., including five species]. ''Int J Syst Bacteriol''. 1981. Vol. 31 (3). hlm. 353-360.</ref>

== Habitat ==
[[Habitat]] utama [[mikroorganisme]] ini adalah di [[tanah]].<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 43.</ref> Biasanya ''D. radiodurans'' diisolasi secara selektif dari [[tanah]], daging mentah, debu, dan [[udara]] yang telah disaring.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 43.</ref> Teknik yang digunakan adalah dengan mengekspos sampel dengan [[radiasi]] [[UV]] atau gamma lalu menumbuhkannya pada media yang kaya tripton dan ekstrak [[khamir]].<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref>

== Ketahanan terhadap radiasi ==
''D. radiodurans'' masih hidup setelah terkena radiasi sebesar 15.000 [[Grays]] (Gy) (1 Gy=100 rad) bahkan dapat terus tumbuh pada kondisi radiasi 69Gy/jam.<ref>Elstov M. ''Fine structure of the ''Deinococcus radiodurans'' nucleoid revealed by cryoelectron microscopy of vitreous sections''. ''J Bacteriol''. 2005. Vol. 187 (23). hlm. 8074-8054. doi:10.1128/JB.187.23.8047–8054.2005.</ref><ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Sebagai perbandingan, [[manusia]] umumnya sudah [[tewas]] bila terekspos radiasi lebih besar dari 10Gy.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Organisme ini lebih tahan terhadap radiasi daripada [[spora]] [[bakteri]].<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Organisme ini juga tahan terhadap banyak agen yang dapat menyebabkan [[mutasi]] pada DNA, seperti [[radiasi]] [[ion]], [[sinar ultraviolet]] (UV), [[hidrogen peroksida]], dan banyak lainnya.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref><ref>Makarova KS. [http://mmbr.asm.org/cgi/reprint/65/1/44.pdf Genome of the extremely radiation-resistant bacterium ''Deinococcus radiodurans'' viewed from perspective of comparative genomics]. ''Microbiol and Molecular Biol Rev''. 2001. Vol. 65 (1). hlm. 44. doi:10.1128/MMBR.65.1.44–79.2001.</ref> Satu-satunya senyawa mutagenik yang dapat menyerang ''D. radiodurans'' adalah [[nitrosoguanidin]] yang dapat menginduksi [[delesi]], yaitu penghilangan suatu fragmen atau [[nukleotida]] DNA.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Delesi lebih berpengaruh pada bakteri ini dibandingkan mutasi titik, yaitu mutasi hanya pada satu atau beberapa nukleotida DNA.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Hal ini karena mekanisme perbaikan terhadap delesi tidak seefisien terhadap mutasi titik.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref>

== Perbaikan DNA yang rusak oleh ''D. radiodurans'' ==
''D. radiodurans'' memiliki mekanisme yang sangat efisien dalam memperbaiki DNA yang rusak.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Ada beberapa jenis [[enzim]] untuk perbaikan DNA di dalam sel organisme ini.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Selain enzim RecA, yang umum ada di organisme untuk perbaikan kerusakan DNA dalam tingkat rendah, ''D. radiodurans'' juga memiliki beberapa RecA-independen sistem DNA yang memungkinkan bakteri ini memperbaiki DNA, utas tunggal maupun utas ganda, dengan sistem penghancuran DNA yang rusak disertai penggantian dengan DNA baru.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Sel ''D. radiodurans'' yang umumnya eksis dalam bentuk tetrad juga dianggap memberikan kontribusi terhadap ketahannya terhadap radiasi dan senyawa mutagenik, karena DNA yang rusak terkumpul rapi membentuk struktur [[cincin toroidal]].<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Mekanisme perbaikan kemudian difasilitasi oleh nukleoid dari bagian sel yang berdekatan, sehingga tetap memungkinkan [[rekombinasi homolog]].<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref> Rekombinasi homolog tersebut menyebabkan sel yang kromosomnya sudah diperbaiki dapat kembali tumbuh dan membelah.<ref>Madigan MT. ''Brock Biology of Microorganisms Twelfth Edition''. Pearson Benjammin Cummings. 2009. hlm. 480-481.</ref>

== Aplikasi ==
Bakteri ''D. radiodurans'' digunakan untuk pengolahan [[limbah]] [[nuklir]] yang mengandung senyawa [[radioaktif]].<ref>Appukuttan D. [http://aem.asm.org/cgi/reprint/72/12/7873?maxtoshow=&hits=10&RESULTFORMAT=&fulltext=Deinococcus+radiodurans+discovery&searchid=1&FIRSTINDEX=0&resourcetype=HWCIT Engineering of ''Deinococcus radiodurans'' R1 for bioprecipitation of uranium from dilute nuclear waste]. ''Appl Environ Microbiol''. 2006. Vol. 72 (12). hlm. 7873-7878. doi:10.1128/AEM.01362-06.</ref> [[Galur]] murni dari bakteri ini diketahui dapat mengurangi [[uranium]] dengan adanya asam humat pada kondisi [[anaerob]].<ref>Appukuttan D. [http://aem.asm.org/cgi/reprint/72/12/7873?maxtoshow=&hits=10&RESULTFORMAT=&fulltext=Deinococcus+radiodurans+discovery&searchid=1&FIRSTINDEX=0&resourcetype=HWCIT Engineering of ''Deinococcus radiodurans'' R1 for bioprecipitation of uranium from dilute nuclear waste]. ''Appl Environ Microbiol''. 2006. Vol. 72 (12). hlm. 7873-7878. doi:10.1128/AEM.01362-06.</ref> ''D. radiodurans'' R1 hasil [[rekayasa genetik]] telah digunakan untuk melaksanakan aktivitas [[bioremediasi]] terhadap [[limbah radioaktif]] campuran, terutama untuk detoksifikasi senyawa [[merkuri]] dan [[toluena]] di dalam limbah.<ref>Appukuttan D. [http://aem.asm.org/cgi/reprint/72/12/7873?maxtoshow=&hits=10&RESULTFORMAT=&fulltext=Deinococcus+radiodurans+discovery&searchid=1&FIRSTINDEX=0&resourcetype=HWCIT Engineering of ''Deinococcus radiodurans'' R1 for bioprecipitation of uranium from dilute nuclear waste]. ''Appl Environ Microbiol''. 2006. Vol. 72 (12). hlm. 7873-7878. doi:10.1128/AEM.01362-06.</ref> Metode ini efektif dan lebih murah untuk menangani limbah global akibat senjata nuklir yang diproduksi pada tahun [[1945]] dan [[1986]].<ref>Brim H. [http://www.nature.com/nbt/journal/v18/n1/full/nbt0100_85.html Engineering Deinococcus radiodurans for metal remediation in radioactive mixed waste environments]. ''Nature Biotechnology''. 2000. Vol. 18. hlm. 85. doi:10.1038/71986.</ref>

== Pranala luar ==
*  [http://jurnal.kesimpulan.com/2011/10/mikrob-tabah-deinococcus-radiodurans.html Mikrob Tabah Deinococcus radiodurans dan Natrialba magadii] [http://jurnal.kesimpulan.com Jurnal KeSimpulan]

== Referensi ==
<references />

== Sumber dan atribusi ==

Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Deinococcus+radiodurans&oldid=29600289 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29600289 (2026-08-19T12:44:58Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Gambar pada artikel ini bersumber dari Wikimedia Commons dan mengikuti ketentuan lisensi masing-masing berkas. Mohon gunakan konten dan media secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

<!-- WIKI_UNISSULA_PRESENTATION_V4 -->