Lihat sumber Thermus aquaticus

[[File:Thermus_aquaticus.JPG|thumb|right|280px|Thermus aquaticus]]

'''''Thermus aquaticus''''' adalah spesies [[bakteri]] yang dapat mentoleransi suhu tinggi, salah satu dari beberapa bakteri [[termofilik]] yang termasuk dalam kelompok [[Deinococcus–Thermus]]. Bakteri ini adalah sumber enzim tahan panas [[Taq polimerase|''Taq'' DNA polimerase]], salah satu enzim paling penting dalam [[biologi molekuler]] karena digunakan dalam teknik amplifikasi DNA [[reaksi berantai polimerase]] (''polymerase chain reaction'', PCR).

== Sejarah ==
Ketika studi tentang organisme biologis di mata air panas dimulai pada 1960-an, para ilmuwan berpikir bahwa bakteri termofilik tidak dapat bertahan hidup pada suhu di atas sekitar .<ref>[http://bioinfo.bact.wisc.edu/themicrobialworld/LAHT/b1.html Thomas Brock's essay "Life at High Temperatures"]</ref> Namun demikian, ditemukan bahwa banyak bakteri di mata air yang berbeda tidak hanya bertahan hidup, tetapi juga berkembang dalam suhu yang lebih tinggi. Pada tahun 1969, [[Thomas D. Brock]] dan Hudson Freeze dari [[Indiana University]] melaporkan [[spesies]] baru bakteri [[termofilik]] yang mereka beri nama ''Thermus aquaticus''.<ref>Brock TD. [https://archive.org/details/sim_journal-of-bacteriology_1969-04_98_1/page/289 ''Thermus aquaticus'', a Nonsporulating Extreme Thermophile]. ''J. Bacteriol''. 1969. Vol. 98 (1). hlm. 289–97.</ref> Bakteri ini pertama kali ditemukan di [[Area geotermal Yellowstone#Upper Geyser Basin|Lower Geyser Basin]] di [[Taman Nasional Yellowstone]], dekat [[Great Fountain Geyser]] dan [[White Dome Geyser]],<ref>T. Scott Bryan. [https://archive.org/details/geysersofyellows0000brya Geysers of Yellowstone, The]. University Press of Colorado. 2008. ISBN 978-0-87081-924-7.</ref> dan sejak itu telah ditemukan di habitat termal yang serupa di seluruh dunia.

== Biologi ==
''Thermus aquaticus'' tumbuh subur pada 70&nbsp;°C (158&nbsp;°F), tetapi dapat bertahan hidup pada suhu 50&nbsp;°C hingga 80&nbsp;°C (122&nbsp;°F hingga 176&nbsp;°F). Bakteri ini adalah [[kemotrof]]—ia melakukan [[kemosintesis]] untuk mendapatkan makanan. Namun, karena kisaran suhu tumpang tindih dengan [[cyanobacteria]] fotosintetik yang berbagi lingkungan yang ideal, kadang-kadang ditemukan hidup bersama dengan tetangganya, memperoleh energi untuk pertumbuhan dari [[fotosintesis]] mereka.

== Morfologi ==
''Thermus aquaticus'' umumnya berbentuk silindris dengan diameter 0,5&nbsp;μm hingga 0,8&nbsp;μm. Bentuk batang yang lebih pendek memiliki panjang 5&nbsp;μm hingga 10&nbsp;μm. Bentuk filamen yang lebih panjang memiliki panjang yang sangat bervariasi dan dalam beberapa kasus melebihi 200 μm. Bakteri berbentuk batang memiliki kecenderungan untuk membentuk agregat. Asosiasi beberapa individu dapat mengarah pada pembentukan badan berbentuk bola berdiameter 10&nbsp;μm hingga 20&nbsp;μm, juga disebut badan-badan rotund.<ref>Brock TD. [https://archive.org/details/sim_journal-of-bacteriology_1969-04_98_1/page/289 ''Thermus aquaticus'', a Nonsporulating Extreme Thermophile]. ''J. Bacteriol''. 1969. Vol. 98 (1). hlm. 289–97.</ref><ref>Brock TD. [https://archive.org/details/sim_journal-of-bacteriology_1970-10_104_1/page/509 Fine Structure of ''Thermus aquaticus'', an Extreme Thermophile]. ''J. Bacteriol''. 1970. Vol. 104 (1). hlm. 509–517.</ref>

== Enzim dari ''T. aquaticus'' ==
''T. aquaticus'' telah menjadi terkenal sebagai sumber enzim termostabil, terutama ''Taq'' polimerase DNA, seperti yang dijelaskan di bawah ini.

=== Aldolase ===
Studi pada bakteri termofilik ekstrem ini yang dapat ditumbuhkan dalam [[kultur sel]] pada awalnya berpusat pada upaya untuk memahami bagaimana [[enzim]] [[protein]] (yang biasanya terinaktivasi pada suhu tinggi) dapat berfungsi pada suhu tinggi di [[termofil]]. Pada tahun 1970, Freeze dan Brock menerbitkan sebuah artikel yang menjelaskan enzim [[Glikolisis|aldolase]] termostabil dari T. aquaticus.<ref>Freeze H. [https://archive.org/details/sim_journal-of-bacteriology_1970-02_101_2/page/540 Thermostable Aldolase from Thermus aquaticus]. ''J. Bacteriol''. 1970. Vol. 101 (2). hlm. 541–50.</ref>

=== RNA polimerase ===
Enzim polimerase pertama yang diisolasi dari ''T. aquaticus'' pada tahun 1974 adalah [[RNA polimerase]] yang bergantung pada DNA,<ref>Air GM. ''DNA-Dependent RNA Polymerase From the Thermophilic Bacterium ''Thermus aquaticus''''. ''FEBS Letters''. 1974. Vol. 38 (3). hlm. 277–281. doi:10.1016/0014-5793(74)80072-4.</ref> yang digunakan dalam proses [[Transkripsi (genetik)|transkripsi]].

=== Enzim restriksi ''Taq'' I ===
Sebagian besar ahli biologi molekuler mungkin menyadari ''T. aquaticus'' pada akhir 1970-an atau awal 1980-an karena isolasi [[Enzim restriksi|endonuklease restriksi]] yang berguna dari organisme ini.<ref>S Sato. ''A single cleavage of Simian virus 40 (SV40) DNA by a site specific endonuclease from Thermus aquaticus, ''Taq'' I''. ''J. Biochem''. February 1978. Vol. 83 (2). hlm. 633–5. doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a131952.</ref> Penggunaan istilah ''Taq'' untuk merujuk pada '''''T'''hermus '''aq'''uaticus'' muncul pada masa ini dari konvensi pemberian nama pendek enzim restriksi, seperti Sal dan Hin, berasal dari genus dan spesies dari organisme sumber.

=== DNA polymerase ("Taq pol") ===
[[DNA polimerase]] pertama kali diisolasi dari ''T. aquaticus'' pada tahun 1976.<ref>A Chien. [https://archive.org/details/sim_journal-of-bacteriology_1976-09_127_3/page/1550 Deoxyribonucleic acid polymerase from the extreme thermophile Thermus aquaticus]. ''J. Bacteriol''. September 1, 1976. Vol. 127 (3). hlm. 1550–7.</ref> Keuntungan pertama yang ditemukan untuk DNA polimerase termostabil ini (temperatur optimum 80&nbsp;°C) adalah bahwa ia dapat diisolasi dalam bentuk yang lebih murni (bebas dari kontaminan enzim lain) daripada DNA polimerase dari sumber lain. Kemudian, [[Kary Mullis]] dan peneliti lain di [[Cetus Corporation]] menemukan enzim ini dapat digunakan dalam proses [[reaksi berantai polimerase]] (PCR) untuk memperbanyak segmen pendek [[DNA]],<ref>RK Saiki. [http://sunsite.berkeley.edu/cgi-bin/ebind2html/pcr/009 Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase]. ''Science''. 1988. Vol. 239 (4839). hlm. 487–91. doi:10.1126/science.2448875.</ref> menghilangkan kebutuhan untuk menambahkan enzim setelah setiap siklus denaturasi termal DNA. Enzim juga [[Kloning molekular|dikloning]], [[Pengurutan DNA|diurutkan]], dimodifikasi (untuk menghasilkan 'fragmen Stoffel' yang lebih pendek), dan diproduksi dalam jumlah besar untuk dijual secara komersial.<ref>Lawyer FC. [https://archive.org/details/genome-research_1993-05_2_4/page/275 High-level expression, purification, and enzymatic characterization of full-length Thermus aquaticus DNA polymerase]. ''PCR Methods Appl''. 1993. Vol. 2 (4). hlm. 275–87. doi:10.1101/gr.2.4.275.</ref> Pada tahun 1989 majalah ''[[Science (jurnal)|Science]]'' menyebut Taq polymerase sebagai "Molecule of the Year" pertama.<ref>Guyer RL. [http://www.sciencemag.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=2688087 The Molecule of the Year]. ''Science''. December 1989. Vol. 246 (4937). hlm. 1543–6. doi:10.1126/science.2688087.</ref> Pada tahun 1993, Dr. [[Kary Mullis]]<ref>https://www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/1993/mullis-lecture.html</ref> dianugerahi [[Penghargaan Nobel Kimia]] untuk karyanya dengan PCR.

=== Enzim lainnya ===
Suhu optimum yang tinggi untuk ''T. aquaticus'' memungkinkan para peneliti untuk mempelajari reaksi dalam kondisi di mana enzim lain kehilangan aktivitasnya. Enzim lain yang diisolasi dari organisme ini termasuk [[DNA ligase]], [[alkalin fosfatase]], [[Oksidase|NADH oksidase]], [[isositrat dehidrogenase]], [[Maltase|amilomaltase]], dan [[Laktat dehidrogenase|L-laktat dehidrogenase bergantung fruktosa 1,6-disfosfat]].

== Kontroversi ==
Penggunaan komersial enzim dari ''T. aquaticus'' tidak bebas dari kontroversi. Setelah studi Dr. Brock, sampel organisme itu disimpan di [[American Type Culture Collection]], sebuah repositori publik. Ilmuwan lain, termasuk ilmuwan di Cetus, mendapatkannya dari sana. Ketika potensi komersial dari ''Taq'' polimerase menjadi jelas pada 1990-an,<ref>Fore J. [http://www.j-biomed-discovery.com/content/1//7 The effects of business practices, licensing, and intellectual property on development and dissemination of the polymerase chain reaction: case study]. ''J Biomed Discov Collab''. 2006. Vol. 1. hlm. 7. doi:10.1186/1747-5333-1-7. — Detailed history of Cetus and the commercial aspects of PCR.</ref> [[National Park Service]] melabeli penggunaannya sebagai "Great ''Taq'' Rip-off".<ref>Robbins J. [https://www.nytimes.com/2006/11/28/science/28yell.html The Search for Private Profit in the Nation's Public Parks]. ''The New York Times''. 28 November 2006.</ref> Para peneliti yang bekerja di National Park Service sekarang diminta untuk menandatangani perjanjian "pembagian manfaat" yang akan mengirim sebagian dari laba yang didapatkan kembali ke Park Service.

== Lihat pula ==
* [[Bioteknologi]]
* [[Geiser]]
* [[Organisme termofil]]

== Bacaan lebih lanjut ==
* 
* 

== Pranala luar ==
* [http://bacdive.dsmz.de/index.php?search=16714&submit=Search Type strain of ''Thermus aquaticus'' at Bac''Dive'' - the Bacterial Diversity Metadatabase]

== Referensi ==
<references />

== Sumber dan atribusi ==

Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Thermus+aquaticus&oldid=29342596 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29342596 (2026-06-13T19:04:08Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Gambar pada artikel ini bersumber dari Wikimedia Commons dan mengikuti ketentuan lisensi masing-masing berkas. Mohon gunakan konten dan media secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

<!-- WIKI_UNISSULA_PRESENTATION_V4 -->