Maintenance script: Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29599833; atribusi sumber disertakan.

2026-09-07T08:28:15Z

Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29599833; atribusi sumber disertakan.

Halaman baru

'''Genomika''' adalah cabang [[biologi]] yang mempelajari [[genom]] dari suatu [[organisme]] atau [[virus]]. Genomika dapat dikatakan sebagai cabang genetika apabila dilihat secara historik, meskipun dalam genomika digunakan banyak metode yang berasal dari cabang biologi lain, seperti [[bioinformatika]] dan [[biologi molekuler]]. Genomika tidak mungkin berdiri sebagai cabang ilmu tanpa bantuan bioinformatika karena objek kajiannya sangat besar dan memerlukan manajemen data yang rumit.

Genomika mengkaji struktur, organisasi serta fungsi dari genom. Objek kajiannya adalah [[DNA]] secara keseluruhan (DNA nuklear/inti, [[cpDNA]], dan [[mtDNA]]) maupun sebagian ("[[gen]]"). [[RNA]] sebagai bahan genetik atau DNA yang dibuat berdasarkan RNA ([[cDNA]]) juga menjadi objek kajian genomika.

== Sejarah ==

=== Etimologi ===
Dari bahasa Yunani ''gen'', "gen" (gamma, epsilon, nu, epsilon) yang berarti "menjadi, membuat, menciptakan, melahirkan", dan varian-varian berikutnya: genealogi, genesis, genetika, genik, genomere, genotipe, genus dll. Sementara kata ''genom'' (dari ''Genom'' [[Bahasa Jerman|Jerman]], dikaitkan dengan [[Hans Winkler]]) digunakan dalam [[bahasa Inggris]] pada awal 1926, istilah ''genomika'' diciptakan oleh Tom Roderick, seorang [[ahli genetika]] di [[Laboratorium Jackson]] ([[Bar Harbor, Maine]]), sambil minum bir di sebuah pertemuan yang diadakan di [[Maryland]] tentang pemetaan genom manusia pada tahun 1986.

=== Upaya pengurutan awal ===
Menyusul konfirmasi [[Rosalind Franklin]] tentang struktur heliks DNA, [[James Dewey Watson|James D. Watson]] dan [[Francis Crick]] memublikasikan struktur DNA pada tahun 1953 dan publikasi [[Frederick Sanger|Fred Sanger]] tentang sekuens insulin [[Asam amino|asam Amino]] pada tahun 1955, pengurutan asam nukleat menjadi target utama [[Biologi molekular|ahli biologi molekuler]] awal. Pada tahun 1964, [[Robert William Holley|Robert W. Holley]] dan rekannya memublikasikan urutan asam nukleat pertama yang pernah ditentukan, urutan [[Asam ribonukleat|ribonukleotida]] dari [[Transfer RNA|RNA transfer]] [[Alanina|alanin]]. Memperluas karya ini, [[Marshall Nirenberg]] dan [[Philip Leder]] mengungkapkan sifat triplet dari [[Kodon|kode genetik]] dan mampu menentukan urutan 54 dari 64 [[kodon]] dalam percobaan mereka. Pada tahun 1972, [[Walter Fiers]] dan timnya di Laboratorium Biologi Molekuler [[Universitas Ghent]] ([[Gent|Ghent]], [[Belgia]]) adalah yang pertama untuk menentukan urutan gen: gen untuk protein mantel [[Bacteriophage MS2|Bakteriofag MS2]]. Kelompok Fiers memperluas kerja mengenai protein mantel MS2 mereka, menentukan urutan nukleotida lengkap bakteriofag MS2-RNA (yang genomnya mengkodekan hanya empat gen dalam 3569 [[pasangan basa]] [bp]) dan [[SV40|virus Simian 40]] masing-masing pada tahun 1976 dan 1978, secara berurutan.

=== Teknologi pengurutan DNA dikembangkan ===
Selain pekerjaan pada urutan asam amino insulin, [[Frederick Sanger]] dan rekan-rekannya memainkan peran kunci dalam pengembangan teknik pengurutan DNA yang memungkinkan pembentukan proyek pengurutan genom yang komprehensif. Pada tahun 1975, ia dan Alan Coulson menerbitkan prosedur pengurutan menggunakan DNA polimerase dengan nukleotida radiolabelled yang ia sebut ''teknik Plus dan Minus''. Ini melibatkan dua metode terkait erat yang menghasilkan oligonukleotida pendek dengan termini 3' yang telah ditentukan. Ini dapat difraksinasi dengan [[elektroforesis]] pada gel [[poliakrilamida]] (disebut elektroforesis gel poliakrilamida) dan divisualisasikan menggunakan autoradiografi. Prosedur ini dapat mengurutkan hingga 80 nukleotida dalam sekali jalan dan merupakan perbaikan besar, tetapi masih sangat melelahkan. Namun demikian, pada tahun 1977 kelompoknya mampu mengurutkan sebagian besar 5.386 nukleotida dari [[bakteriofag]] untai tunggal [[Phi X 174|17X174]], menyelesaikan genom berbasis DNA yang sepenuhnya diurutkan. Penyempurnaan metode ''Plus dan Minus'' menghasilkan penghentian rantai, atau [[metode Sanger]], yang membentuk dasar teknik pengurutan DNA, pemetaan genom, penyimpanan data, dan analisis bioinformatika yang paling banyak digunakan pada penelitian 25 tahun setelahnya. Pada tahun yang sama [[Walter Gilbert]] dan [[Allan Maxam]] dari [[Universitas Harvard]] secara independen mengembangkan metode [[Urutan Maxam-Gilbert|Maxam-Gilbert]] (juga dikenal sebagai ''metode kimia'') dari pengurutan DNA, yang melibatkan pembelahan preferensial DNA pada basis yang diketahui, metode yang kurang efisien. Untuk pekerjaan inovatif mereka dalam pengurutan asam nukleat, Gilbert dan Sanger berbagi setengah dari [[Penghargaan Nobel|Hadiah Nobel]] 1980 dalam bidang kimia dengan [[Paul Berg]] ([[DNA rekombinan]]).

=== Genom lengkap ===

Munculnya teknologi ini menghasilkan intensifikasi cepat dalam ruang lingkup dan kecepatan penyelesaian [[Proyek genom|proyek pengurutan genom]]. Urutan genom lengkap pertama dari [[Organel|organel eukariotik]], [[mitokondria]] manusia (16.568 bp, sekitar 16,6 kb [kilobasa]), dilaporkan pada tahun 1981, dan genom [[kloroplas]] pertama diikuti pada tahun 1986. Pada tahun 1992, [[kromosom]] eukariotik pertama, kromosom III ragi bir ''[[Saccharomyces cerevisiae]]'' (315 kb) diurutkan. Organisme hidup bebas pertama yang diurutkan adalah ''[[Haemophilus influenzae]]'' (1,8 Mb [megabasa]) pada tahun 1995. Tahun berikutnya konsorsium peneliti dari laboratorium di seluruh [[Amerika Utara]], [[Eropa]], dan [[Jepang]] mengumumkan penyelesaian urutan genom lengkap lengkap dari eukariota, ''[[Saccharomyces cerevisiae|S. cerevisiae]]'' (12,1 Mb), dan sejak itu genom terus diurutkan dengan pertumbuhan yang eksponensial. , urutan basa lengkap tersedia untuk: 2.719 [[virus]], 1.115 [[Arkea|archaea]] dan [[bakteri]], dan 36 [[eukariota]], di mana sekitar setengahnya merupakan [[Fungi|jamur]].

Sebagian besar mikroorganisme yang genomnya telah diurutkan sepenuhnya adalah [[Patogen|patogen yang]] bermasalah, seperti ''[[Haemophilus influenzae]]'', yang telah mengakibatkan bias yang jelas dalam distribusi filogenetik mereka dibandingkan dengan luasnya keanekaragaman mikrob. Dari spesies yang telah diurutkan, sebagian besar dipilih karena mereka adalah organisme model yang dipelajari dengan baik atau potensial untuk menjadi model yang baik. Ragi (''[[Saccharomyces cerevisiae]]'') telah lama menjadi [[Organisme model|model organisme]] penting bagi [[Eukariota|sel eukariotik]], sedangkan lalat buah ''[[Drosophila melanogaster]]'' telah menjadi alat yang sangat penting (terutama pada [[genetika]] pra-molekul awal). Cacing ''[[Caenorhabditis elegans]]'' adalah model sederhana yang sering digunakan untuk [[organisme multiseluler]]. ''[[Brachydanio rerio|Zachrafis Brachydanio rerio]]'' digunakan untuk banyak studi perkembangan pada tingkat molekuler, dan tanaman ''[[Arabidopsis thaliana]]'' adalah model organisme untuk tanaman berbunga. Ikan [[Ikan buntal Jepang|buntal Jepang]] (''[[Rubif Takifugu|Takifugu rubripes]]'') dan [[ikan buntal hijau berbintik]]-[[Ikan buntal hijau berbintik|bintik]] (''[[Tetraodon nigroviridis]]'') menarik karena genomnya yang kecil dan padat, yang mengandung sangat sedikit [[DNA bukan kode|DNA nonkode]] dibandingkan dengan kebanyakan spesies. Anjing (''[[Anjing|Canis familiaris]]''), tikus coklat (''[[Tikus got|Rattus norvegicus]])'', tikus (''[[Mencit|Mus musculus]]''), dan simpanse (''[[Geser troglodytes|Pan troglodytes]]'') adalah semua hewan model penting dalam penelitian medis.

Draf kasar [[genom manusia]] diselesaikan oleh [[Proyek Genom Manusia]] pada awal 2001, menciptakan banyak keriuhan. Proyek ini, selesai pada tahun 2003, mengurutkan seluruh genom untuk satu orang tertentu, dan pada 2007 urutan ini dinyatakan "selesai" (kurang dari satu kesalahan dalam 20.000 basis dan semua kromosom terkumpul). Pada tahun-tahun sejak saat itu, genom dari banyak individu lain telah diurutkan, sebagian di bawah naungan [[Proyek 1000 Genom]], yang mengumumkan pengurutan 1.092 genom pada Oktober 2012. Penyelesaian proyek ini dimungkinkan oleh pengembangan teknologi pengurutan yang jauh lebih efisien dan membutuhkan komitmen sumber daya [[bioinformatika]] yang signifikan dari kolaborasi internasional besar. Analisis lanjutan data genom manusia memiliki dampak politik dan sosial yang mendalam bagi masyarakat manusia.

=== Revolusi "omika" ===

'''"Omika"''' yaitu [[neologisme]] dari bahasa Inggris yang secara informal merujuk pada bidang studi biologi yang diakhiri dengan ''-omika'', seperti genomika, [[Proteomika|proteomik]]<nowiki/>a, atau [[metabolomika]]. Akhiran terkait '''-om''' digunakan untuk mengatasi objek studi bidang tersebut, seperti masing-masing [[genom]], [[proteom]] atau [[metabolom]] . Akhiran ''-om'' seperti yang digunakan dalam biologi molekuler mengacu pada ''totalitas'' terhadap sesuatu, sedangkan '''-omika''' merujuk secara umum pada studi kumpulan data biologis yang besar dan komprehensif. Sementara pertumbuhan dalam penggunaan istilah ini telah menyebabkan beberapa ilmuwan ([[Jonathan A. Eisen|Jonathan Eisen]]) mengklaim bahwa istilah tersebut telah digunakan secara berlebih, itu mencerminkan perubahan dalam orientasi menuju analisis kuantitatif lengkap atau hampir lengkap bermacam-macam semua konstituen dari suatu sistem. Dalam studi [[simbiosis]], misalnya, para peneliti yang dulunya terbatas pada studi produk gen tunggal sekarang dapat secara bersamaan membandingkan total komplemen dari beberapa jenis molekul biologis.

== Bidang genomika ==

=== Genomika struktural ===
Genomika ini berfokus pada konstruksi genetik sebuah genom. Bebrapa aktivitas dalam genomika ini meliputi konstruksi genom, identifikasi gen di dalam genom, anotasi genom, dan perbandingan antar struktur genom. Istilah genomika ini telah digunakan oleh bidang biologi struktural lebih dahulu dalam mengkaji struktur tiga dimensi setiap protein yang disandi oleh sebuah genom.

=== Genomika fungsional ===
Genomika ini disebut pula transkriptomika yang mempelajari ekspresi gen secara menyeluruh oleh sebuah genom pada kondisi tertentu, seperti fungsi gen dan memahami peran genom.

== Aplikasi genomika ==
Genomika telah menyediakan aplikasi di banyak bidang, termasuk [[kedokteran]], [[bioteknologi]], [[antropologi]], dan [[ilmu sosial]] lainnya.

=== Genomika medis ===
Teknologi genomika generasi selanjutnya memungkinkan dokter dan peneliti biomedis untuk secara drastis meningkatkan jumlah data genom yang dikumpulkan pada populasi penelitian yang besar. Ketika dikombinasikan dengan pendekatan informatika baru yang mengintegrasikan banyak jenis data dengan data genom dalam penelitian penyakit, ini memungkinkan para peneliti untuk lebih memahami dasar genetik dari respon obat dan penyakit. Sebagai contoh, program penelitian ''All of Us'' bertujuan untuk mengumpulkan data urutan genom dari 1 juta peserta untuk menjadi komponen penting dari platform penelitian obat presisi.

=== Biologi sintesis dan bioteknologi ===
Pertumbuhan pengetahuan genomik telah memungkinkan aplikasi [[Biologi sintetis|biologi sintetik]] yang semakin canggih. Pada 2010, para peneliti di [[Institut J. Craig Venter|J. Craig Venter Institute]] mengumumkan penciptaan spesies [[Bakteri|bakteri yang]] sebagian sintetis, ''[[laboratorium Mycoplasma]]'', yang berasal dari [[genom]] ''[[Mycoplasma genitalium]]''.

=== Genomika konservasi ===
Konservasionis dapat menggunakan informasi yang dikumpulkan oleh pengurutan genom untuk mengevaluasi faktor genetik kunci untuk konservasi spesies, seperti [[Keanekaragaman genetika|keragaman genetik]] populasi atau apakah individu heterozigot untuk kelainan genetik bawaan yang resesif. Dengan menggunakan data genom untuk mengevaluasi efek dari [[Evolusi|proses evolusi]] dan untuk mendeteksi pola dalam variasi di seluruh populasi tertentu, para pelestari lingkungan dapat merumuskan rencana untuk membantu spesies tertentu tanpa banyak variabel yang tidak diketahui seperti yang tidak dapat ditangani oleh [[Genetika konservasi|pendekatan genetik]] standar.

== Lihat pula ==
* [[Transkriptomika]]
* [[Proteomika]]
* [[Metabolomika]]
* [[Daftar cabang biologi]]
* [[Pusat Riset Genomik Pertanian]]

== Referensi ==

== Sumber dan atribusi ==

Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Genomika&oldid=29599833 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29599833 (2026-08-19T10:36:17Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

Genomika - Riwayat revisi

Maintenance script: Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29599833; atribusi sumber disertakan.