Maintenance script: Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

2026-08-29T18:14:26Z

Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

← Revisi sebelumnya		Revisi per 29 Agustus 2026 18.14
Baris 1:		Baris 1:
	~~'''Ikatan fosfodiester''' terjadi ketika tepatnya dua~~ [[~~gugus hidroksil]] dalam [[asam fosfat~~]] ~~bereaksi dengan gugus hidroksil pada molekul lain untuk membentuk dua ikatan [[ester]].~~		[[File:Phosphodiester_Bond_Diagram.svg\|thumb\|right\|280px\|Phosphodiester Bond Diagram]]

	Ikatan fosfodiester ~~adalah pusat dari semua kehidupan di~~ [[~~Bumi~~]] ~~karena mereka membentuk tulang punggung untaian~~ [[asam ~~nukleat~~]]~~. Dalam [[DNA]] dan [[RNA]], ikatan fosfodiester adalah hubungan antara atom karbon~~ pada ~~posisi 3' dari satu~~ molekul ~~gula dan atom karbon pada posisi 5' dari atom~~ lain, [[~~deoksiribosa~~]] ~~dalam DNA dan~~ [~~[ribosa~~]~~] dalam RNA~~.~~[[Ikatan kovalen]] yang kuat terbentuk antara [[gugus fosfat]] dan dua cincin [[karbohidrat]] berkarbon 5 ([[pentosa]]) di atas dua ikatan [[ester]]~~.		'''Ikatan fosfodiester''' terjadi ketika tepatnya dua [[gugus hidroksil]] dalam [[asam fosfat]] bereaksi dengan gugus hidroksil pada molekul lain untuk membentuk dua ikatan [[ester]].<ref>[https://teaching.ncl.ac.uk/bms/wiki/index.php/Phosphodiester_bond Phosphodiester bond]. ''School of BioMedical Sciences Wiki''.</ref>

	~~Gugus fosfat dalam ikatan~~ fosfodiester ~~bermuatan negatif~~. ~~Karena gugus fosfat memiliki~~ [[~~Konstanta kesetimbangan\|pK<sub>a</sub>~~]] ~~mendekati 0~~, ~~mereka bermuatan negatif~~ pada ~~pH 7~~. ~~Gaya tolakan ini memaksa~~ fosfat ~~untuk mengambil sisi berlawanan dari untaian DNA~~ dan ~~dinetralkan oleh protein~~ ([[~~histon~~]])~~, ion logam seperti~~ [[~~Magnesium dalam biologi#Asam nukleat\|magnesium~~]], and ~~[[poliamina]~~].		Ikatan fosfodiester adalah pusat dari semua kehidupan di [[Bumi]] karena mereka membentuk tulang punggung untaian [[asam nukleat]]. Dalam [[DNA]] dan [[RNA]], ikatan fosfodiester adalah hubungan antara atom karbon pada posisi 3' dari satu molekul gula dan atom karbon pada posisi 5' dari atom lain, [[deoksiribosa]] dalam DNA dan [[ribosa]] dalam RNA.[[Ikatan kovalen]] yang kuat terbentuk antara [[gugus fosfat]] dan dua cincin [[karbohidrat]] berkarbon 5 ([[pentosa]]) di atas dua ikatan [[ester]].<ref>Richard R. Sinden. [https://books.google.co.id/books?id=Q6Yd-qYvx9UC&pg=PA9 DNA Structure and Function]. Gulf Professional Publishing. 1994. hlm. 9. ISBN 9780126457506.</ref>

	~~Agar~~ ikatan fosfodiester ~~terbentuk dan~~ [[~~nukleotida~~]] ~~bergabung~~, ~~bentuk tri-fosfat atau di~~-fosfat dari ~~blok-blok pembangun nukleotida terpecah untuk menghasilkan energi yang dibutuhkan untuk menggerakkan~~ [[~~Enzim~~\|~~reaksi yang dikatalisis oleh enzim~~]]~~. Ketika satu fosfat atau dua fosfat yang dikenal sebagai~~ [[~~pirofosfat~~]] ~~terlepas dan mengkatalisasi reaksi~~, ~~ikatan fosfodiester terbentuk~~.		Gugus fosfat dalam ikatan fosfodiester bermuatan negatif. Karena gugus fosfat memiliki [[Konstanta kesetimbangan\|pK<sub>a</sub>]] mendekati 0, mereka bermuatan negatif pada pH 7.<ref>Laplace Plaisance. ''Fundamental Biochemistry''. McGraf Educational. 2007. hlm. 331-334.</ref> Gaya tolakan ini memaksa fosfat untuk mengambil sisi berlawanan dari untaian DNA dan dinetralkan oleh protein ([[histon]]), ion logam seperti [[Magnesium dalam biologi#Asam nukleat\|magnesium]], and [[poliamina]].<ref>Kohwi Y, Kohwi-Shigematsu T. ''Magnesium ion-dependent triple-helix structure formed by homopurine-homopyrimidine sequences in supercoiled plasmid DNA''. ''Proc Natl Acad Sci U S A''. 1988. Vol. 85 (11). hlm. 3781-5. doi:10.1073/pnas.85.11.3781.</ref>

	[[~~Hidrolisis~~]] ~~ikatan fosfodiester dapat dikatalisasi~~ oleh ~~aksi~~ [[~~fosfodiesterase~~]] ~~yang berperan penting dalam memperbaiki sekuens DNA~~.		Agar ikatan fosfodiester terbentuk dan [[nukleotida]] bergabung, bentuk tri-fosfat atau di-fosfat dari blok-blok pembangun nukleotida terpecah untuk menghasilkan energi yang dibutuhkan untuk menggerakkan [[Enzim\|reaksi yang dikatalisis oleh enzim]]. Ketika satu fosfat atau dua fosfat yang dikenal sebagai [[pirofosfat]] terlepas dan mengkatalisasi reaksi, ikatan fosfodiester terbentuk.<ref>M. V. Kulkarni. ''Biochemistry''. Pragati Books. 2008. hlm. 57-60. ISBN 9788185790060.</ref>

	Hubungan fosfodiester antara dua [[ribonukleotida]] dapat dipatahkan oleh [[hidrolisis basa]], sedangkan hubungan antara dua [[deoksiribonukleotida]] lebih stabil dalam kondisi ini. Kemudahan relatif [[hidrolisis RNA]] adalah efek dari keberadaan [[hidroksil\|gugus hidroksil]] pada posisi 2'.		[[Hidrolisis]] ikatan fosfodiester dapat dikatalisasi oleh aksi [[fosfodiesterase]] yang berperan penting dalam memperbaiki sekuens DNA.<ref>Bruce Alberts. ''Molecular Biology of the Cell''. Garland Science. 2017. hlm. 240. ISBN 9781317563754.</ref>

			Hubungan fosfodiester antara dua [[ribonukleotida]] dapat dipatahkan oleh [[hidrolisis basa]], sedangkan hubungan antara dua [[deoksiribonukleotida]] lebih stabil dalam kondisi ini. Kemudahan relatif [[hidrolisis RNA]] adalah efek dari keberadaan [[hidroksil\|gugus hidroksil]] pada posisi 2'.<ref>Donald Voet. ''Biochemistry''. John Wiley & Sons. 2011. hlm. 85. ISBN 9780470570951.</ref>

	== Gangguan molekul DNA dan RNA ==		== Gangguan molekul DNA dan RNA ==
	Beberapa agen dapat memutus ikatan fosfodiester. Di antara yang lebih umum adalah [[peroksida]] dan berbagai ion [[logam]] (mis., , ). [[Radiasi pengion]] juga secara efisien menghasilkan putusnya untai tersebut. DNase yang terdapat dalam sel mungkin juga terkadang dapat memutuskan ikatan fosfodiester. Kerusakan untai ganda, yaitu, dua untaian dari untai tunggal yang berlawanan satu sama lain, dapat disebabkan dari paparan semua bentuk radiasi pengion. Pemutusan untai tunggal dapat diperbaiki dengan [[DNA ligase]], meskipun kadang-kadang dibutuhkan enzim tambahan.		Beberapa agen dapat memutus ikatan fosfodiester. Di antara yang lebih umum adalah [[peroksida]] dan berbagai ion [[logam]] (mis., , ). [[Radiasi pengion]] juga secara efisien menghasilkan putusnya untai tersebut. DNase yang terdapat dalam sel mungkin juga terkadang dapat memutuskan ikatan fosfodiester. Kerusakan untai ganda, yaitu, dua untaian dari untai tunggal yang berlawanan satu sama lain, dapat disebabkan dari paparan semua bentuk radiasi pengion. Pemutusan untai tunggal dapat diperbaiki dengan [[DNA ligase]], meskipun kadang-kadang dibutuhkan enzim tambahan.<ref>Bhagavan, N.V. ''Medical Biochemistry''. Elsevier, Inc. 2002. ISBN 9780120954407.</ref>

	[[Spesi oksigen reaktif]] (ROS) mampu membelah ikatan fosfodiester yang menahan basa dalam RNA dan DNA bersama-sama dan memecah struktur rantai RNA dan DNA. ROS mengoksidasi basa purin dan [[Pirimidina\|pirimidin]] serta mencegah pemasangan basa yang tepat. Posisi karbon 8 dari purin adalah situs yang sangat sensitif untuk oksidasi oleh ROS; pembentukan 8-hidroksiguanin atau 8-hidroksiadenin, 8-hidroksi-deoksiguanin atau 8-hidroksi-deoksiadenin adalah masing-masing merupakan pijakan bagi serangan ROS pada RNA atau DNA. ROS dapat menyebabkan [[deaminasi]], yaitu, menghilangkan gugus [[amino]] dari [[adenin]] atau [[guanin]] untuk membentuk [[hipoksantina]] atau [[xantina]], masing-masing, atau menghilangkan gugus amino dari [[sitosin]] untuk membentuk [[urasil]]. Reaksi ini mengubah pasangan basa yang benar dalam DNA. Reaksi-reaksi tersebut merupakan penyebab utama terjadinya [[mutasi]].		[[Spesi oksigen reaktif]] (ROS) mampu membelah ikatan fosfodiester yang menahan basa dalam RNA dan DNA bersama-sama dan memecah struktur rantai RNA dan DNA. ROS mengoksidasi basa purin dan [[Pirimidina\|pirimidin]] serta mencegah pemasangan basa yang tepat. Posisi karbon 8 dari purin adalah situs yang sangat sensitif untuk oksidasi oleh ROS; pembentukan 8-hidroksiguanin atau 8-hidroksiadenin, 8-hidroksi-deoksiguanin atau 8-hidroksi-deoksiadenin adalah masing-masing merupakan pijakan bagi serangan ROS pada RNA atau DNA. ROS dapat menyebabkan [[deaminasi]], yaitu, menghilangkan gugus [[amino]] dari [[adenin]] atau [[guanin]] untuk membentuk [[hipoksantina]] atau [[xantina]], masing-masing, atau menghilangkan gugus amino dari [[sitosin]] untuk membentuk [[urasil]]. Reaksi ini mengubah pasangan basa yang benar dalam DNA. Reaksi-reaksi tersebut merupakan penyebab utama terjadinya [[mutasi]].<ref>Cederbaum, A.I. ''Liver Pathophysiology''. Elsevier, Inc. 2017. ISBN 9780128042748.</ref>

	== Aktivitas enzim ==		== Aktivitas enzim ==
	Fosfodiesterase adalah enzim yang mengkatalisis hidrolisis ikatan fosfodiester, misalnya ikatan dalam molekul [[AMP siklik\|cAMP]] atau [[GMP siklik]].		Fosfodiesterase adalah enzim yang mengkatalisis hidrolisis ikatan fosfodiester, misalnya ikatan dalam molekul [[AMP siklik\|cAMP]] atau [[GMP siklik]].<ref>''Isozymes of cyclic nucleotide phosphodiesterases''. John Wiley and Sons. hlm. 61-85.</ref><ref>Joseph A. Beavo. ''Primary sequence of cyclic nucleotide phosphodiesterase isozymes and the design of selective inhibitors''. ''Trends in Pharmacological Sciences''. April 1990. Vol. 11 (4). hlm. 150-155. doi:10.1016/0165-6147(90)90066-H.</ref>

	Enzim yang memainkan peran penting dalam perbaikan kerusakan DNA oksidatif adalah 3'-fosfodiesterase.		Enzim yang memainkan peran penting dalam perbaikan kerusakan DNA oksidatif adalah 3'-fosfodiesterase.<ref>Jac A. Nickoloff. ''DNA Damage and Repair: Advances from Phage to Humans''. Springer Science & Business Media. 2001. ISBN 9781592590957.</ref>

	Selama replikasi DNA, terdapat lubang di antara fosfat pada tulang belakang yang ditinggalkan oleh [[DNA polimerase I]]. [[DNA ligase]] dapat membentuk ikatan fosfodiester antara nukleotida.		Selama replikasi DNA, terdapat lubang di antara fosfat pada tulang belakang yang ditinggalkan oleh [[DNA polimerase I]]. [[DNA ligase]] dapat membentuk ikatan fosfodiester antara nukleotida.<ref>Ian D. Hickson. ''Base Excision Repair of DNA Damage''. Springer Science & Business Media. 1999. ISBN 9780412131615.</ref>

	== Lihat pula ==		== Lihat pula ==
Baris 31:		Baris 33:

	== Referensi ==		== Referensi ==
			<references />

			== Sumber dan atribusi ==

			Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ikatan+fosfodiester&oldid=29304602 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29304602 (2026-06-01T15:46:38Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Gambar pada artikel ini bersumber dari Wikimedia Commons dan mengikuti ketentuan lisensi masing-masing berkas. Mohon gunakan konten dan media secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

	~~== Sumber dan atribusi ==~~		<!-- WIKI_UNISSULA_PRESENTATION_V4 -->

	~~Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ikatan+fosfodiester&oldid=29304602 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29304602 (2026~~-06-~~01T15:46:38Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi~~-~~BerbagiSerupa (CC BY~~-~~SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.~~

Maintenance script: Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29304602; atribusi sumber disertakan.

2026-08-29T17:50:12Z

Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29304602; atribusi sumber disertakan.

Halaman baru

'''Ikatan fosfodiester''' terjadi ketika tepatnya dua [[gugus hidroksil]] dalam [[asam fosfat]] bereaksi dengan gugus hidroksil pada molekul lain untuk membentuk dua ikatan [[ester]].

Ikatan fosfodiester adalah pusat dari semua kehidupan di [[Bumi]] karena mereka membentuk tulang punggung untaian [[asam nukleat]]. Dalam [[DNA]] dan [[RNA]], ikatan fosfodiester adalah hubungan antara atom karbon pada posisi 3' dari satu molekul gula dan atom karbon pada posisi 5' dari atom lain, [[deoksiribosa]] dalam DNA dan [[ribosa]] dalam RNA.[[Ikatan kovalen]] yang kuat terbentuk antara [[gugus fosfat]] dan dua cincin [[karbohidrat]] berkarbon 5 ([[pentosa]]) di atas dua ikatan [[ester]].

Gugus fosfat dalam ikatan fosfodiester bermuatan negatif. Karena gugus fosfat memiliki [[Konstanta kesetimbangan|pK<sub>a</sub>]] mendekati 0, mereka bermuatan negatif pada pH 7. Gaya tolakan ini memaksa fosfat untuk mengambil sisi berlawanan dari untaian DNA dan dinetralkan oleh protein ([[histon]]), ion logam seperti [[Magnesium dalam biologi#Asam nukleat|magnesium]], and [[poliamina]].

Agar ikatan fosfodiester terbentuk dan [[nukleotida]] bergabung, bentuk tri-fosfat atau di-fosfat dari blok-blok pembangun nukleotida terpecah untuk menghasilkan energi yang dibutuhkan untuk menggerakkan [[Enzim|reaksi yang dikatalisis oleh enzim]]. Ketika satu fosfat atau dua fosfat yang dikenal sebagai [[pirofosfat]] terlepas dan mengkatalisasi reaksi, ikatan fosfodiester terbentuk.

[[Hidrolisis]] ikatan fosfodiester dapat dikatalisasi oleh aksi [[fosfodiesterase]] yang berperan penting dalam memperbaiki sekuens DNA.

Hubungan fosfodiester antara dua [[ribonukleotida]] dapat dipatahkan oleh [[hidrolisis basa]], sedangkan hubungan antara dua [[deoksiribonukleotida]] lebih stabil dalam kondisi ini. Kemudahan relatif [[hidrolisis RNA]] adalah efek dari keberadaan [[hidroksil|gugus hidroksil]] pada posisi 2'.

== Gangguan molekul DNA dan RNA ==
Beberapa agen dapat memutus ikatan fosfodiester. Di antara yang lebih umum adalah [[peroksida]] dan berbagai ion [[logam]] (mis., , ). [[Radiasi pengion]] juga secara efisien menghasilkan putusnya untai tersebut. DNase yang terdapat dalam sel mungkin juga terkadang dapat memutuskan ikatan fosfodiester. Kerusakan untai ganda, yaitu, dua untaian dari untai tunggal yang berlawanan satu sama lain, dapat disebabkan dari paparan semua bentuk radiasi pengion. Pemutusan untai tunggal dapat diperbaiki dengan [[DNA ligase]], meskipun kadang-kadang dibutuhkan enzim tambahan.

[[Spesi oksigen reaktif]] (ROS) mampu membelah ikatan fosfodiester yang menahan basa dalam RNA dan DNA bersama-sama dan memecah struktur rantai RNA dan DNA. ROS mengoksidasi basa purin dan [[Pirimidina|pirimidin]] serta mencegah pemasangan basa yang tepat. Posisi karbon 8 dari purin adalah situs yang sangat sensitif untuk oksidasi oleh ROS; pembentukan 8-hidroksiguanin atau 8-hidroksiadenin, 8-hidroksi-deoksiguanin atau 8-hidroksi-deoksiadenin adalah masing-masing merupakan pijakan bagi serangan ROS pada RNA atau DNA. ROS dapat menyebabkan [[deaminasi]], yaitu, menghilangkan gugus [[amino]] dari [[adenin]] atau [[guanin]] untuk membentuk [[hipoksantina]] atau [[xantina]], masing-masing, atau menghilangkan gugus amino dari [[sitosin]] untuk membentuk [[urasil]]. Reaksi ini mengubah pasangan basa yang benar dalam DNA. Reaksi-reaksi tersebut merupakan penyebab utama terjadinya [[mutasi]].

== Aktivitas enzim ==
Fosfodiesterase adalah enzim yang mengkatalisis hidrolisis ikatan fosfodiester, misalnya ikatan dalam molekul [[AMP siklik|cAMP]] atau [[GMP siklik]].

Enzim yang memainkan peran penting dalam perbaikan kerusakan DNA oksidatif adalah 3'-fosfodiesterase.

Selama replikasi DNA, terdapat lubang di antara fosfat pada tulang belakang yang ditinggalkan oleh [[DNA polimerase I]]. [[DNA ligase]] dapat membentuk ikatan fosfodiester antara nukleotida.

== Lihat pula ==
* [[Fosfodiesterase]]
* [[Inhibitor fosfodiesterase]]
* [[Replikasi DNA]], [[DNA]], [[Adenosina trifosfat|ATP]]
* [[Asam teikoat]], [[DNase I]]
* [[PDE5]]

== Referensi ==

== Sumber dan atribusi ==

Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ikatan+fosfodiester&oldid=29304602 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29304602 (2026-06-01T15:46:38Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

Ikatan fosfodiester - Riwayat revisi

Maintenance script: Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

Maintenance script: Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29304602; atribusi sumber disertakan.