Pengurutan - Riwayat revisi

Maintenance script: Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

2026-08-28T17:59:02Z

Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

← Revisi sebelumnya		Revisi per 28 Agustus 2026 17.59
Baris 5:		Baris 5:
	== Sekuensing asam nukleat ==		== Sekuensing asam nukleat ==
	=== Sekuensing DNA ===		=== Sekuensing DNA ===

	Sekuensing DNA adalah proses penentuan urutan [[nukleotida]] pada suatu fragmen [[DNA]]. Dewasa ini, hampir semua usaha '''sekuensing DNA''' dilakukan dengan menggunakan metode ''terminasi rantai'' yang dikembangkan oleh Frederick Sanger dan rekan-rekannya [http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?artid=431765]. Teknik tersebut melibatkan terminasi atau penghentian reaksi sintesis DNA ''in vitro'' yang spesifik untuk sekuens tertentu menggunakan substrat nukleotida yang telah dimodifikasi.		Sekuensing DNA adalah proses penentuan urutan [[nukleotida]] pada suatu fragmen [[DNA]]. Dewasa ini, hampir semua usaha '''sekuensing DNA''' dilakukan dengan menggunakan metode ''terminasi rantai'' yang dikembangkan oleh Frederick Sanger dan rekan-rekannya [http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?artid=431765]. Teknik tersebut melibatkan terminasi atau penghentian reaksi sintesis DNA ''in vitro'' yang spesifik untuk sekuens tertentu menggunakan substrat nukleotida yang telah dimodifikasi.

Baris 17:		Baris 16:

	== Sekuensing protein ==		== Sekuensing protein ==


	'''Sekuensing protein''' atau '''sekuensing peptida''' adalah penentuan urutan [[asam amino]] pada suatu [[protein]] atau [[peptida]] ([[oligopeptida]] maupun [[polipeptida]]). Metode untuk sekuensing [[protein]] umumnya melibatkan pemutusan [[ikatan kimia\|ikatan]] yang diikuti dengan identifikasi asam amino.		'''Sekuensing protein''' atau '''sekuensing peptida''' adalah penentuan urutan [[asam amino]] pada suatu [[protein]] atau [[peptida]] ([[oligopeptida]] maupun [[polipeptida]]). Metode untuk sekuensing [[protein]] umumnya melibatkan pemutusan [[ikatan kimia\|ikatan]] yang diikuti dengan identifikasi asam amino.

Baris 28:		Baris 25:

	== Sekuensing polisakarida ==		== Sekuensing polisakarida ==

	Walaupun [[polisakarida]] juga merupakan [[biopolimer]] (yang termasuk dalam [[karbohidrat]] dengan monomer [[monosakarida]]), tidaklah lazim untuk melakukan 'sekuensing' polisakarida, karena beberapa alasan. Walaupun banyak polisakarida yang berstruktur rantai lurus, banyak pula yang berstruktur bercabang. Terdapat banyak sekali jenis [[monosakarida]] yang dapat menyusun polisakarida dengan banyak macam cara [[ikatan kimia]] pula. Selain itu, alasan teoretis utama ketidaklaziman sekuensing polisakarida adalah bahwa masing-masing polimer lain yang disebutkan di atas secara umum dibentuk oleh satu jenis [[enzim]] berdasarkan 'cetakan' tertentu, sedangkan satu penggabungan monomer pada polisakarida dapat dibentuk oleh berbagai jenis enzim. Sering kali pembentukan ikatan polimer polisakarida tidaklah spesifik; bergantung pada enzim yang beraksi, satu dari beberapa jenis monomer dapat digabungkan. Hal ini dapat mengakibatkan terbentuknya sekelompok molekul yang mirip satu sama lain.		Walaupun [[polisakarida]] juga merupakan [[biopolimer]] (yang termasuk dalam [[karbohidrat]] dengan monomer [[monosakarida]]), tidaklah lazim untuk melakukan 'sekuensing' polisakarida, karena beberapa alasan. Walaupun banyak polisakarida yang berstruktur rantai lurus, banyak pula yang berstruktur bercabang. Terdapat banyak sekali jenis [[monosakarida]] yang dapat menyusun polisakarida dengan banyak macam cara [[ikatan kimia]] pula. Selain itu, alasan teoretis utama ketidaklaziman sekuensing polisakarida adalah bahwa masing-masing polimer lain yang disebutkan di atas secara umum dibentuk oleh satu jenis [[enzim]] berdasarkan 'cetakan' tertentu, sedangkan satu penggabungan monomer pada polisakarida dapat dibentuk oleh berbagai jenis enzim. Sering kali pembentukan ikatan polimer polisakarida tidaklah spesifik; bergantung pada enzim yang beraksi, satu dari beberapa jenis monomer dapat digabungkan. Hal ini dapat mengakibatkan terbentuknya sekelompok molekul yang mirip satu sama lain.

Baris 38:		Baris 34:
	* [[Biosintesis protein]]		* [[Biosintesis protein]]
	* [[Sekuensing asam nukleat]]		* [[Sekuensing asam nukleat]]



	== Sumber dan atribusi ==		== Sumber dan atribusi ==

	Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pengurutan&oldid=28656569 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 28656569 (2025-12-03T06:14:04Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.		Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pengurutan&oldid=28656569 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 28656569 (2025-12-03T06:14:04Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

			<!-- WIKI_UNISSULA_PRESENTATION_V4 -->

Maintenance script: Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 28656569; atribusi sumber disertakan.

2026-08-28T17:21:24Z

Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 28656569; atribusi sumber disertakan.

Halaman baru

:''Untuk "sekuensing" dalam [[musik elektronik]], lihat artikel [[sekuenser musik]].''

Dalam [[genetika]] dan [[biokimia]], '''sekuensing''' berarti penentuan [[struktur primer]] (atau sekuens primer) rantai [[biopolimer]] tak bercabang. Sekuensing menghasilkan penggambaran linear simbolik yang disebut '''sekuens''' yang meringkas sebagian besar struktur tingkat atom atas molekul yang di-sekuensing. Sebagai contoh, ''sekuensing [[DNA]]'' akan menghasilkan ''[[sekuens DNA]]'' yang digambarkan sebagai untaian [[abjad]] lambang [[nukleotida|nukleotida-nukleotida]] penyusun DNA, yaitu "A" (nukleotida berbasa [[adenin]]), "T" (nukleotida berbasa [[timin]]), "G" (nukleotida berbasa [[guanin]]), dan "C" (nukleotida berbasa [[sitosin]]).

== Sekuensing asam nukleat ==
=== Sekuensing DNA ===

Sekuensing DNA adalah proses penentuan urutan [[nukleotida]] pada suatu fragmen [[DNA]]. Dewasa ini, hampir semua usaha '''sekuensing DNA''' dilakukan dengan menggunakan metode ''terminasi rantai'' yang dikembangkan oleh Frederick Sanger dan rekan-rekannya [http://www.pubmedcentral.gov/articlerender.fcgi?artid=431765]. Teknik tersebut melibatkan terminasi atau penghentian reaksi sintesis DNA ''in vitro'' yang spesifik untuk sekuens tertentu menggunakan substrat nukleotida yang telah dimodifikasi.

Pada metode sekuensing terminasi rantai (metode Sanger), perpanjangan atau ekstensi rantai DNA dimulai pada situs spesifik pada DNA cetakan dengan menggunakan oligonukleotida pendek yang disebut ''primer'' yang komplementer terhadap DNA pada daerah situs tersebut. ''Primer'' tersebut diperpanjang menggunakan [[DNA polimerase]], enzim yang me[[replikasi]] DNA. Bersama dengan ''primer'' dan DNA polimerase, diikutsertakan pula empat jenis basa [[deoksinukleotida]] (satuan pembentuk DNA), juga nukleotida pemutus atau penghenti rantai (''terminator'' rantai) dalam konsentrasi rendah. Penggabungan nukleotida pemutus rantai tersebut secara terbatas kepada rantai DNA oleh polimerase DNA menghasilkan fragmen-fragmen DNA yang berhenti bertumbuh hanya pada posisi pada DNA tempat nukleotida tertentu tersebut tergabungkan. Fragmen-fragmen DNA tersebut lalu dipisahkan menurut ukurannya dengan [[elektroforesis]].

Metode sekuensing DNA yang lain adalah metode Maxam dan Gilbert yang didasari oleh modifikasi kimiawi DNA yang dilanjutkan dengan pemotongan DNA [http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pubmed&pubmedid=265521].
Metode ini mulanya cukup populer, namun seiring dengan dikembangkannya metode terminasi rantai menjadi semakin mudah dan murah, metode sekuensing Maxam-Gilbert menjadi tidak populer.

=== Sekuensing RNA ===
Kadang kala sekuensing RNA diperlukan walaupun informasi yang dikandung [[RNA]] sudah terdapat di dalam [[DNA]], khususnya pada [[eukariota]]. [[RNA]] lebih tidak stabil daripada DNA di dalam sel dan lebih rentan terhadap penguraian oleh enzim [[nuklease]] secara laboratorium. Dalam sekuensing RNA, metode yang umum digunakan adalah mula-mula membentuk fragmen DNA dari RNA tersebut dengan enzim [[transkriptase balik]]. Misalnya, DNA dapat disintesis dari cetakan [[mRNA]] dan disebut sebagai [[DNA komplementer]] (cDNA). Fragmen DNA tersebut kemudian dapat disekuensing dengan cara seperti yang disebutkan di atas.

== Sekuensing protein ==

'''Sekuensing protein''' atau '''sekuensing peptida''' adalah penentuan urutan [[asam amino]] pada suatu [[protein]] atau [[peptida]] ([[oligopeptida]] maupun [[polipeptida]]). Metode untuk sekuensing [[protein]] umumnya melibatkan pemutusan [[ikatan kimia|ikatan]] yang diikuti dengan identifikasi asam amino.

Pada metode [[:en:edman degradation|degradasi Edman]], residu pada ujung-N (ujung amino) [[protein]] dipotong satu per satu dengan reaksi kimia. Setelah setiap pemotongan, residu [[asam amino]] yang telah dipotong tersebut dapat diidentifikasi menggunakan [[kromatografi]]. Prosedur tersebut diulangi untuk setiap residu asam amino. Kelemahan metode ini adalah bahwa polipeptida yang di-sekuensing tidak dapat lebih panjang dari 50–60 residu (dapat disiasati dengan memotong-motong polipeptida berukuran besar menjadi peptida-peptida berukuran lebih kecil sebelum dilakukan reaksi).

Metode sekuensing protein yang lain memanfaatkan [[spektrometri massa]] yang mampu mengukur [[massa]] [[peptida]] dengan tepat. Protein yang hendak di-sekuensing dipotong-potong secara [[enzim]]atik maupun [[reaksi kimia|kimia]] menjadi peptida-peptida yang kemudian dianalisis menggunakan spektrometri massa. Dalam proses spektrometri massa, peptida-peptida tersebut dipecah secara [[ionisasi]], misalnya dengan bantuan [[laser]] pada metode ''matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight spectrometry'' (spektrometri "ionisasi desorpsi laser dengan bantuan matriks"-"waktu terbang"/[[:en:MALDI-TOF|MALDI-TOF]]), kemudian [[ion|ion-ion]] residu yang dihasilkan ditentukan massanya. Pada metode ''[[:en:Peptide mass fingerprinting|peptide mass fingerprinting]]'' ("penyidikjarian massa peptida"), data massa fragmen-fragmen peptida tersebut dianalisis secara [[bioinformatika]] dengan rujukan [[basis data]] besar asam nukleat untuk menentukan sekuens protein asalnya (secara [[statistika]] berdasarkan data asam nukleat pada basis data tersebut). Selain itu, sekuens protein juga dapat ditentukan langsung dengan spektrometri massa pada metode ''[[:en:tandem mass spectrometry|tandem mass spectrometry]]'' ("spektrometri massa tandem").

Jika [[gen]] penyandi suatu protein dapat diidentifikasi, saat ini jauh lebih mudah melakukan sekuensing [[DNA]] dari gen tersebut dan menentukan sekuens proteinnya dari sekuens DNA itu dibandingkan dengan harus melakukan sekuensing terhadap protein itu sendiri. Sebaliknya, penentuan sebagian sekuens [[asam amino]] suatu protein (biasanya dari salah satu ujung rantai proteinnya) dapat memungkinkan identifikasi [[klon]] pembawa gen tersebut.

== Sekuensing polisakarida ==

Walaupun [[polisakarida]] juga merupakan [[biopolimer]] (yang termasuk dalam [[karbohidrat]] dengan monomer [[monosakarida]]), tidaklah lazim untuk melakukan 'sekuensing' polisakarida, karena beberapa alasan. Walaupun banyak polisakarida yang berstruktur rantai lurus, banyak pula yang berstruktur bercabang. Terdapat banyak sekali jenis [[monosakarida]] yang dapat menyusun polisakarida dengan banyak macam cara [[ikatan kimia]] pula. Selain itu, alasan teoretis utama ketidaklaziman sekuensing polisakarida adalah bahwa masing-masing polimer lain yang disebutkan di atas secara umum dibentuk oleh satu jenis [[enzim]] berdasarkan 'cetakan' tertentu, sedangkan satu penggabungan monomer pada polisakarida dapat dibentuk oleh berbagai jenis enzim. Sering kali pembentukan ikatan polimer polisakarida tidaklah spesifik; bergantung pada enzim yang beraksi, satu dari beberapa jenis monomer dapat digabungkan. Hal ini dapat mengakibatkan terbentuknya sekelompok molekul yang mirip satu sama lain.

== Referensi dan bacaan lanjutan ==
* Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2002) ''[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=mboc4.TOC&depth=10 Molecular Biology of the Cell]''. Edisi ke-4. Garland Science: New York. ISBN 0-8153-3218-1. ([http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.section.1522#1550 Sekuensing protein dengan spektrometri massa])
* Berg, J. M., Stryer, L. et al. (2002) ''[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=stryer.TOC&depth=10 Biochemistry]''. W.H. Freeman & Co. ISBN 0-7167-4684-0. ([http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=stryer.section.483 Degradasi Edman di buku ini])

== Lihat pula ==
* [[Biosintesis protein]]
* [[Sekuensing asam nukleat]]

== Sumber dan atribusi ==

Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Pengurutan&oldid=28656569 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 28656569 (2025-12-03T06:14:04Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.