Reaksi berantai polimerase tersarang - Riwayat revisi

Maintenance script: Pembersihan konten sesuai kebijakan Wiki Unissula

2026-09-09T09:11:37Z

Pembersihan konten sesuai kebijakan Wiki Unissula

← Revisi sebelumnya		Revisi per 9 September 2026 09.11
Baris 2:		Baris 2:

	'''Reaksi berantai polimerase tersarang''' () adalah suatu teknik perbanyakan ([[replikasi]]) sampel [[DNA]] menggunakan bantuan [[enzim]] [[DNA polimerase]] yang menggunakan dua pasang [[primer PCR]] untuk mengamplifikasi [[fragmen]].<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>		'''Reaksi berantai polimerase tersarang''' () adalah suatu teknik perbanyakan ([[replikasi]]) sampel [[DNA]] menggunakan bantuan [[enzim]] [[DNA polimerase]] yang menggunakan dua pasang [[primer PCR]] untuk mengamplifikasi [[fragmen]].<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>
	Pasangan primer yang pertama akan mengamplifikasi [[fragmen]] yang cara kerjanya mirip dengan [[PCR]] pada umumnya.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Sedangkan, pasangan primer yang kedua biasanya disebut primer tersarang (sepasang primer tersebut terletak di dalam fragmen pertama) yang berikatan di dalam fragmen produk PCR yang pertama untuk memungkinkan terjadinya [[amplifikasi]] produk PCR yang kedua dimana hasilnya lebih pendek dari yang pertama.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Dengan menggunakan PCR tersarang, jika ada fragmen yang salah diamplifikasi maka kemungkinan bagian tersebut diamplifikasi untuk kedua kalinya oleh primer yang kedua sangat rendah.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref><ref>Chauhan HC, Kher HN, Chandel BS, Dadawala AL, Jain L, Agrawal SM, Bhadaniya A. 2009. Evaluation of group specific nested pcr for detection of bluetongue virus. ''Veterinary World'' 2(5):179-182.</ref> Dengan demikian, PCR tersarang adalah PCR yang sangat [[spesifik]] dalam melakukan [[amplifikasi]].<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>		Pasangan primer yang pertama akan mengamplifikasi [[fragmen]] yang cara kerjanya mirip dengan [[PCR]] pada umumnya.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Sedangkan, pasangan primer yang kedua biasanya disebut primer tersarang (sepasang primer tersebut terletak di dalam fragmen pertama) yang berikatan di dalam fragmen produk PCR yang pertama untuk memungkinkan terjadinya [[amplifikasi]] produk PCR yang kedua dimana hasilnya lebih pendek dari yang pertama.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Dengan menggunakan PCR tersarang, jika ada fragmen yang salah diamplifikasi maka kemungkinan bagian tersebut diamplifikasi untuk kedua kalinya oleh primer yang kedua sangat rendah.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Dengan demikian, PCR tersarang adalah PCR yang sangat [[spesifik]] dalam melakukan [[amplifikasi]].<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>

	== Perbedaan PCR tersarang dengan PCR biasa ==		== Perbedaan PCR tersarang dengan PCR biasa ==
	PCR tersarang merupakan [[variasi]] dari reaksi berantai polimerase biasa (PCR).<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> PCR tersarang dan PCR biasa keduanya berguna untuk memperbanyak fragmen [[DNA]] tertentu dalam jumlah banyak.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref><ref>Chauhan HC, Kher HN, Chandel BS, Dadawala AL, Jain L, Agrawal SM, Bhadaniya A. 2009. Evaluation of group specific nested pcr for detection of bluetongue virus. ''Veterinary World'' 2(5):179-182.</ref> Pada PCR tersarang digunakan 2 pasang primer, sedangkan pada PCR biasa hanya menggunakan 1 pasang primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Oleh karena itu, hasil fragmen DNA dari PCR tersarang lebih [[spesifik]] (lebih pendek) dibandingkan dengan PCR biasa.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Waktu yang diperlukan dalam reaksi PCR tersarang lebih lama daripada PCR biasa karena pada PCR tersarang dilakukan 2 kali reaksi PCR sedangkan pada PCR biasa hanya 1 kali reaksi PCR.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Selain itu, keuntungan PCR tersarang adalah meminimalkan kesalahan amplifikasi [[gen]] dengan menggunakan 2 pasang primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref><ref>Chauhan HC, Kher HN, Chandel BS, Dadawala AL, Jain L, Agrawal SM, Bhadaniya A. 2009. Evaluation of group specific nested pcr for detection of bluetongue virus. ''Veterinary World'' 2(5):179-182.</ref>		PCR tersarang merupakan [[variasi]] dari reaksi berantai polimerase biasa (PCR).<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> PCR tersarang dan PCR biasa keduanya berguna untuk memperbanyak fragmen [[DNA]] tertentu dalam jumlah banyak.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Pada PCR tersarang digunakan 2 pasang primer, sedangkan pada PCR biasa hanya menggunakan 1 pasang primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Oleh karena itu, hasil fragmen DNA dari PCR tersarang lebih [[spesifik]] (lebih pendek) dibandingkan dengan PCR biasa.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Waktu yang diperlukan dalam reaksi PCR tersarang lebih lama daripada PCR biasa karena pada PCR tersarang dilakukan 2 kali reaksi PCR sedangkan pada PCR biasa hanya 1 kali reaksi PCR.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Selain itu, keuntungan PCR tersarang adalah meminimalkan kesalahan amplifikasi [[gen]] dengan menggunakan 2 pasang primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>

	== Mekanisme kerja ==		== Mekanisme kerja ==

Maintenance script: Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

2026-08-29T13:58:49Z

Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi

← Revisi sebelumnya		Revisi per 29 Agustus 2026 13.58
Baris 1:		Baris 1:
	'''Reaksi berantai polimerase tersarang''' () adalah suatu teknik perbanyakan ([[replikasi]]) sampel [[DNA]] menggunakan bantuan [[enzim]] [[DNA polimerase]] yang menggunakan dua pasang [[primer PCR]] untuk mengamplifikasi [[fragmen]].		[[File:Nested_PCR.png\|thumb\|right\|280px\|Nested PCR]]
	Pasangan primer yang pertama akan mengamplifikasi [[fragmen]] yang cara kerjanya mirip dengan [[PCR]] pada umumnya. Sedangkan, pasangan primer yang kedua biasanya disebut primer tersarang (sepasang primer tersebut terletak di dalam fragmen pertama) yang berikatan di dalam fragmen produk PCR yang pertama untuk memungkinkan terjadinya [[amplifikasi]] produk PCR yang kedua dimana hasilnya lebih pendek dari yang pertama. Dengan menggunakan PCR tersarang, jika ada fragmen yang salah diamplifikasi maka kemungkinan bagian tersebut diamplifikasi untuk kedua kalinya oleh primer yang kedua sangat rendah. Dengan demikian, PCR tersarang adalah PCR yang sangat [[spesifik]] dalam melakukan [[amplifikasi]].
			'''Reaksi berantai polimerase tersarang''' () adalah suatu teknik perbanyakan ([[replikasi]]) sampel [[DNA]] menggunakan bantuan [[enzim]] [[DNA polimerase]] yang menggunakan dua pasang [[primer PCR]] untuk mengamplifikasi [[fragmen]].<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>
			Pasangan primer yang pertama akan mengamplifikasi [[fragmen]] yang cara kerjanya mirip dengan [[PCR]] pada umumnya.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Sedangkan, pasangan primer yang kedua biasanya disebut primer tersarang (sepasang primer tersebut terletak di dalam fragmen pertama) yang berikatan di dalam fragmen produk PCR yang pertama untuk memungkinkan terjadinya [[amplifikasi]] produk PCR yang kedua dimana hasilnya lebih pendek dari yang pertama.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Dengan menggunakan PCR tersarang, jika ada fragmen yang salah diamplifikasi maka kemungkinan bagian tersebut diamplifikasi untuk kedua kalinya oleh primer yang kedua sangat rendah.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref><ref>Chauhan HC, Kher HN, Chandel BS, Dadawala AL, Jain L, Agrawal SM, Bhadaniya A. 2009. Evaluation of group specific nested pcr for detection of bluetongue virus. ''Veterinary World'' 2(5):179-182.</ref> Dengan demikian, PCR tersarang adalah PCR yang sangat [[spesifik]] dalam melakukan [[amplifikasi]].<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref>

	== Perbedaan PCR tersarang dengan PCR biasa ==		== Perbedaan PCR tersarang dengan PCR biasa ==
	PCR tersarang merupakan [[variasi]] dari reaksi berantai polimerase biasa (PCR). PCR tersarang dan PCR biasa keduanya berguna untuk memperbanyak fragmen [[DNA]] tertentu dalam jumlah banyak. Pada PCR tersarang digunakan 2 pasang primer, sedangkan pada PCR biasa hanya menggunakan 1 pasang primer. Oleh karena itu, hasil fragmen DNA dari PCR tersarang lebih [[spesifik]] (lebih pendek) dibandingkan dengan PCR biasa. Waktu yang diperlukan dalam reaksi PCR tersarang lebih lama daripada PCR biasa karena pada PCR tersarang dilakukan 2 kali reaksi PCR sedangkan pada PCR biasa hanya 1 kali reaksi PCR. Selain itu, keuntungan PCR tersarang adalah meminimalkan kesalahan amplifikasi [[gen]] dengan menggunakan 2 pasang primer.		PCR tersarang merupakan [[variasi]] dari reaksi berantai polimerase biasa (PCR).<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> PCR tersarang dan PCR biasa keduanya berguna untuk memperbanyak fragmen [[DNA]] tertentu dalam jumlah banyak.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref><ref>Chauhan HC, Kher HN, Chandel BS, Dadawala AL, Jain L, Agrawal SM, Bhadaniya A. 2009. Evaluation of group specific nested pcr for detection of bluetongue virus. ''Veterinary World'' 2(5):179-182.</ref> Pada PCR tersarang digunakan 2 pasang primer, sedangkan pada PCR biasa hanya menggunakan 1 pasang primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Oleh karena itu, hasil fragmen DNA dari PCR tersarang lebih [[spesifik]] (lebih pendek) dibandingkan dengan PCR biasa.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Waktu yang diperlukan dalam reaksi PCR tersarang lebih lama daripada PCR biasa karena pada PCR tersarang dilakukan 2 kali reaksi PCR sedangkan pada PCR biasa hanya 1 kali reaksi PCR.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Selain itu, keuntungan PCR tersarang adalah meminimalkan kesalahan amplifikasi [[gen]] dengan menggunakan 2 pasang primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref><ref>Chauhan HC, Kher HN, Chandel BS, Dadawala AL, Jain L, Agrawal SM, Bhadaniya A. 2009. Evaluation of group specific nested pcr for detection of bluetongue virus. ''Veterinary World'' 2(5):179-182.</ref>

	== Mekanisme kerja ==		== Mekanisme kerja ==
	Secara umum, PCR adalah suatu [[proses]] perbanyakan [[DNA]] secara ''[[in vitro]]'' melalui beberapa [[tahap]], yaitu [[denaturasi]], penempelan primer, dan pemanjangan. Prinsip kerja PCR tersarang tidak jauh berbeda dengan PCR biasa, tetapi PCR tersarang akan bekerja menggunakan dua pasang primer untuk mengamplifikasi [[fragmen]] DNA [[spesifik]] melalui dua proses PCR secara terpisah. Pertama-tama DNA mengalami denaturasi lalu memasuki fase penempelan, di mana sepasang primer pertama melekat di kedua utas tunggal DNA dan mengamplifikasi DNA di antara kedua primer tersebut dan terbentuklah produk PCR pertama. Kemudian produk PCR pertama tersebut dijalankan pada proses PCR kedua di mana pasangan primer kedua (primer tersarang) akan mengenali [[sekuen]] DNA spesifik yang berada di dalam fragmen produk PCR pertama dan memulai [[amplifikasi]] bagian di antara kedua primer tersebut. Hasilnya adalah sekuens DNA yang lebih pendek daripada sekuens DNA hasil PCR pertama.		Secara umum, PCR adalah suatu [[proses]] perbanyakan [[DNA]] secara ''[[in vitro]]'' melalui beberapa [[tahap]], yaitu [[denaturasi]], penempelan primer, dan pemanjangan.<ref>Louise AM, Scott AA, Patricia BM, Stephen JR, Mark C, Martin OS, Shern LC, Adrian JLC. 2001. Pseudoexon Activation as a Novel Mechanism for Disease Resulting in Atypical Growth-Hormone Insensitivity. ''Am. J. Hum. Genet''. 69:641–46.</ref> Prinsip kerja PCR tersarang tidak jauh berbeda dengan PCR biasa, tetapi PCR tersarang akan bekerja menggunakan dua pasang primer untuk mengamplifikasi [[fragmen]] DNA [[spesifik]] melalui dua proses PCR secara terpisah.<ref>Louise AM, Scott AA, Patricia BM, Stephen JR, Mark C, Martin OS, Shern LC, Adrian JLC. 2001. Pseudoexon Activation as a Novel Mechanism for Disease Resulting in Atypical Growth-Hormone Insensitivity. ''Am. J. Hum. Genet''. 69:641–46.</ref> Pertama-tama DNA mengalami denaturasi lalu memasuki fase penempelan, di mana sepasang primer pertama melekat di kedua utas tunggal DNA dan mengamplifikasi DNA di antara kedua primer tersebut dan terbentuklah produk PCR pertama.<ref>Louise AM, Scott AA, Patricia BM, Stephen JR, Mark C, Martin OS, Shern LC, Adrian JLC. 2001. Pseudoexon Activation as a Novel Mechanism for Disease Resulting in Atypical Growth-Hormone Insensitivity. ''Am. J. Hum. Genet''. 69:641–46.</ref> Kemudian produk PCR pertama tersebut dijalankan pada proses PCR kedua di mana pasangan primer kedua (primer tersarang) akan mengenali [[sekuen]] DNA spesifik yang berada di dalam fragmen produk PCR pertama dan memulai [[amplifikasi]] bagian di antara kedua primer tersebut.<ref>Louise AM, Scott AA, Patricia BM, Stephen JR, Mark C, Martin OS, Shern LC, Adrian JLC. 2001. Pseudoexon Activation as a Novel Mechanism for Disease Resulting in Atypical Growth-Hormone Insensitivity. ''Am. J. Hum. Genet''. 69:641–46.</ref> Hasilnya adalah sekuens DNA yang lebih pendek daripada sekuens DNA hasil PCR pertama.<ref>Louise AM, Scott AA, Patricia BM, Stephen JR, Mark C, Martin OS, Shern LC, Adrian JLC. 2001. Pseudoexon Activation as a Novel Mechanism for Disease Resulting in Atypical Growth-Hormone Insensitivity. ''Am. J. Hum. Genet''. 69:641–46.</ref>

	== Aplikasi ==		== Aplikasi ==
	PCR tersarang memiliki aplikasi yang luas dalam bidang kesehatan dan identifikasi [[parasit]]. Karena PCR tersarang memiliki [[sensitivitas]] dan [[spesifitas]] yang lebih tinggi dibanding PCR biasa, hasil yang didapat akan lebih [[akurat]]. Keakuratan PCR tersarang karena daerah yang diinginkan akan diamplifikasi dua kali, dengan dua set primer. Beberapa contoh aplikasinya antara lain adalah dalam mendiagnosis penyakit [[tuberkulosis luar paru]] yang disebabkan oleh ''Mycobacterium tuberculosis'', deteksi ''[[Taenia solium]]'' pada penyakit [[taeniasis]], dan diagnosis [[leptospirosis]].		PCR tersarang memiliki aplikasi yang luas dalam bidang kesehatan dan identifikasi [[parasit]].<ref>Mayta H et al. 2008. Nested PCR for specific diagnosis of Taenia solium Taeniasis. ''J Clin Microbiol'' 46(1):286-289.</ref><ref>Nassi F. 2003. Leptospirosis diagnosis using Nested-PCR. Braz. ''J. Microbiol''. 34(1):90-92.</ref> Karena PCR tersarang memiliki [[sensitivitas]] dan [[spesifitas]] yang lebih tinggi dibanding PCR biasa, hasil yang didapat akan lebih [[akurat]].<ref>Mayta H et al. 2008. Nested PCR for specific diagnosis of Taenia solium Taeniasis. ''J Clin Microbiol'' 46(1):286-289.</ref> Keakuratan PCR tersarang karena daerah yang diinginkan akan diamplifikasi dua kali, dengan dua set primer.<ref>PCRstation. 2009. Nested PCR [terhubung berkala]. http://www.pcrstation.com/nested-pcr/ [26 Apr 2009].</ref> Beberapa contoh aplikasinya antara lain adalah dalam mendiagnosis penyakit [[tuberkulosis luar paru]] yang disebabkan oleh ''Mycobacterium tuberculosis'', deteksi ''[[Taenia solium]]'' pada penyakit [[taeniasis]],<ref>Mayta H et al. 2008. Nested PCR for specific diagnosis of Taenia solium Taeniasis. ''J Clin Microbiol'' 46(1):286-289.</ref> dan diagnosis [[leptospirosis]].<ref>Nassi F. 2003. Leptospirosis diagnosis using Nested-PCR. Braz. ''J. Microbiol''. 34(1):90-92.</ref>

	[[Diagnosis]] penyakit tuberkulosis luar paru sebenarnya bisa saja menggunakan PCR biasa, tetapi PCR biasa tidak memiliki sensitifitas dan reabilitas setinggi PCR tersarang untuk mendiagnosis dengan akurat. Kekurangan PCR ini berhubungan dengan kondisi pengambilan sampel yang [[heterogen]], adanya faktor yang memengaruhi amplifikasi, dan hilangnya [[patogen]] selama proses. Berhubungan dengan hal tersebut, disimpulkan bahwa PCR yang biasa digunakan tidak memiliki [[sensitifitas]] dan [[reabilitas]] yang tinggi. Tes ini didasarkan pada amplifikasi fragmen 986.		[[Diagnosis]] penyakit tuberkulosis luar paru sebenarnya bisa saja menggunakan PCR biasa, tetapi PCR biasa tidak memiliki sensitifitas dan reabilitas setinggi PCR tersarang untuk mendiagnosis dengan akurat.<ref>Skotnikova OI etal. 1999. Application of Nested PCR technique for the diagnosis of Tuberculosis. ''Bulletin of experimental biology and medicine'' 129 (6):612-614.</ref> Kekurangan PCR ini berhubungan dengan kondisi pengambilan sampel yang [[heterogen]], adanya faktor yang memengaruhi amplifikasi, dan hilangnya [[patogen]] selama proses.<ref>Skotnikova OI etal. 1999. Application of Nested PCR technique for the diagnosis of Tuberculosis. ''Bulletin of experimental biology and medicine'' 129 (6):612-614.</ref> Berhubungan dengan hal tersebut, disimpulkan bahwa PCR yang biasa digunakan tidak memiliki [[sensitifitas]] dan [[reabilitas]] yang tinggi.<ref>Skotnikova OI etal. 1999. Application of Nested PCR technique for the diagnosis of Tuberculosis. ''Bulletin of experimental biology and medicine'' 129 (6):612-614.</ref> Tes ini didasarkan pada amplifikasi fragmen 986.<ref>Skotnikova OI etal. 1999. Application of Nested PCR technique for the diagnosis of Tuberculosis. ''Bulletin of experimental biology and medicine'' 129 (6):612-614.</ref>

	Keunggulan lain PCR tersarang adalah proses yang tidak memakan banyak waktu dibandingkan dengan proses lainnya, seperti teknik kultur biasa. Pada diagnosis penyakit tuberkulosis luar paru ini, dibandingkan efektivitas antara teknik PCR tersarang yang menargetkan [[gen]] MPB64 dari ''Mycobacterium tuberculosis'' dan teknik kultur pada media ''Lowenstein Jensen'' (LJ) medium. Percobaan ini melibatkan 400 [[sampel]] klinis yang diduga menderita tuberkulosis luar paru dan 30 [[spesimen]] kontrol nontuberkulosis yang kemudian dikultur dan dideteksi dengan PCR tersarang. Pada perbandingan hasil antara teknik kultur pada media LJ dengan PCR tersarang, hasil dari teknik kultur pada media LJ dari 400 spesimen [[klinis]] hanya 16 spesimen yang menunjukkan hasil positif. Pada hasil dari PCR tersarang, dari 400 spesimen klinis terdapat 141 hasil positif (35.2 %). Sedangkan, pada spesimen kontrol hasilnya negatif dengan PCR tersarang. Pada percobaan ini dapat dilihat bahwa PCR tersarang memiliki keakuratan dan sensitivitas yang tinggi, serta tidak memakan waktu, terlebih dibandingkan dengan metode [[kultur]] [[konvensional]].		Keunggulan lain PCR tersarang adalah proses yang tidak memakan banyak waktu dibandingkan dengan proses lainnya, seperti teknik kultur biasa.<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref> Pada diagnosis penyakit tuberkulosis luar paru ini, dibandingkan efektivitas antara teknik PCR tersarang yang menargetkan [[gen]] MPB64 dari ''Mycobacterium tuberculosis'' dan teknik kultur pada media ''Lowenstein Jensen'' (LJ) medium.<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref> Percobaan ini melibatkan 400 [[sampel]] klinis yang diduga menderita tuberkulosis luar paru dan 30 [[spesimen]] kontrol nontuberkulosis yang kemudian dikultur dan dideteksi dengan PCR tersarang.<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref> Pada perbandingan hasil antara teknik kultur pada media LJ dengan PCR tersarang, hasil dari teknik kultur pada media LJ dari 400 spesimen [[klinis]] hanya 16 spesimen yang menunjukkan hasil positif.<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref> Pada hasil dari PCR tersarang, dari 400 spesimen klinis terdapat 141 hasil positif (35.2 %).<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref> Sedangkan, pada spesimen kontrol hasilnya negatif dengan PCR tersarang.<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref> Pada percobaan ini dapat dilihat bahwa PCR tersarang memiliki keakuratan dan sensitivitas yang tinggi, serta tidak memakan waktu, terlebih dibandingkan dengan metode [[kultur]] [[konvensional]].<ref>Therese KL,Jayanthi U, Madhavan HN. 2005. Application of Nested Polymerase Chain Reaction (nPCR) Using MPB 64 Gene Primers to Detect Mycobacterium Tuberculosis DNA in Clinical Specimens From Extrapulmonary Tuberculosis Patients. ''Indian J Med Res''. 122:165–170.</ref>

	== Referensi ==		== Referensi ==
			<references />

			== Sumber dan atribusi ==

			Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Reaksi+berantai+polimerase+tersarang&oldid=29599865 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29599865 (2026-08-19T10:40:41Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Gambar pada artikel ini bersumber dari Wikimedia Commons dan mengikuti ketentuan lisensi masing-masing berkas. Mohon gunakan konten dan media secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

	~~== Sumber dan atribusi ==~~		<!-- WIKI_UNISSULA_PRESENTATION_V4 -->

	~~Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Reaksi+berantai+polimerase+tersarang&oldid=29599865 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29599865 (2026~~-08-~~19T10:40:41Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi~~-~~BerbagiSerupa (CC BY~~-~~SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.~~

Maintenance script: Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29599865; atribusi sumber disertakan.

2026-08-29T13:19:10Z

Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 29599865; atribusi sumber disertakan.

Halaman baru

'''Reaksi berantai polimerase tersarang''' () adalah suatu teknik perbanyakan ([[replikasi]]) sampel [[DNA]] menggunakan bantuan [[enzim]] [[DNA polimerase]] yang menggunakan dua pasang [[primer PCR]] untuk mengamplifikasi [[fragmen]].
Pasangan primer yang pertama akan mengamplifikasi [[fragmen]] yang cara kerjanya mirip dengan [[PCR]] pada umumnya. Sedangkan, pasangan primer yang kedua biasanya disebut primer tersarang (sepasang primer tersebut terletak di dalam fragmen pertama) yang berikatan di dalam fragmen produk PCR yang pertama untuk memungkinkan terjadinya [[amplifikasi]] produk PCR yang kedua dimana hasilnya lebih pendek dari yang pertama. Dengan menggunakan PCR tersarang, jika ada fragmen yang salah diamplifikasi maka kemungkinan bagian tersebut diamplifikasi untuk kedua kalinya oleh primer yang kedua sangat rendah. Dengan demikian, PCR tersarang adalah PCR yang sangat [[spesifik]] dalam melakukan [[amplifikasi]].

== Perbedaan PCR tersarang dengan PCR biasa ==
PCR tersarang merupakan [[variasi]] dari reaksi berantai polimerase biasa (PCR). PCR tersarang dan PCR biasa keduanya berguna untuk memperbanyak fragmen [[DNA]] tertentu dalam jumlah banyak. Pada PCR tersarang digunakan 2 pasang primer, sedangkan pada PCR biasa hanya menggunakan 1 pasang primer. Oleh karena itu, hasil fragmen DNA dari PCR tersarang lebih [[spesifik]] (lebih pendek) dibandingkan dengan PCR biasa. Waktu yang diperlukan dalam reaksi PCR tersarang lebih lama daripada PCR biasa karena pada PCR tersarang dilakukan 2 kali reaksi PCR sedangkan pada PCR biasa hanya 1 kali reaksi PCR. Selain itu, keuntungan PCR tersarang adalah meminimalkan kesalahan amplifikasi [[gen]] dengan menggunakan 2 pasang primer.

== Mekanisme kerja ==
Secara umum, PCR adalah suatu [[proses]] perbanyakan [[DNA]] secara ''[[in vitro]]'' melalui beberapa [[tahap]], yaitu [[denaturasi]], penempelan primer, dan pemanjangan. Prinsip kerja PCR tersarang tidak jauh berbeda dengan PCR biasa, tetapi PCR tersarang akan bekerja menggunakan dua pasang primer untuk mengamplifikasi [[fragmen]] DNA [[spesifik]] melalui dua proses PCR secara terpisah. Pertama-tama DNA mengalami denaturasi lalu memasuki fase penempelan, di mana sepasang primer pertama melekat di kedua utas tunggal DNA dan mengamplifikasi DNA di antara kedua primer tersebut dan terbentuklah produk PCR pertama. Kemudian produk PCR pertama tersebut dijalankan pada proses PCR kedua di mana pasangan primer kedua (primer tersarang) akan mengenali [[sekuen]] DNA spesifik yang berada di dalam fragmen produk PCR pertama dan memulai [[amplifikasi]] bagian di antara kedua primer tersebut. Hasilnya adalah sekuens DNA yang lebih pendek daripada sekuens DNA hasil PCR pertama.

== Aplikasi ==
PCR tersarang memiliki aplikasi yang luas dalam bidang kesehatan dan identifikasi [[parasit]]. Karena PCR tersarang memiliki [[sensitivitas]] dan [[spesifitas]] yang lebih tinggi dibanding PCR biasa, hasil yang didapat akan lebih [[akurat]]. Keakuratan PCR tersarang karena daerah yang diinginkan akan diamplifikasi dua kali, dengan dua set primer. Beberapa contoh aplikasinya antara lain adalah dalam mendiagnosis penyakit [[tuberkulosis luar paru]] yang disebabkan oleh ''Mycobacterium tuberculosis'', deteksi ''[[Taenia solium]]'' pada penyakit [[taeniasis]], dan diagnosis [[leptospirosis]].

[[Diagnosis]] penyakit tuberkulosis luar paru sebenarnya bisa saja menggunakan PCR biasa, tetapi PCR biasa tidak memiliki sensitifitas dan reabilitas setinggi PCR tersarang untuk mendiagnosis dengan akurat. Kekurangan PCR ini berhubungan dengan kondisi pengambilan sampel yang [[heterogen]], adanya faktor yang memengaruhi amplifikasi, dan hilangnya [[patogen]] selama proses. Berhubungan dengan hal tersebut, disimpulkan bahwa PCR yang biasa digunakan tidak memiliki [[sensitifitas]] dan [[reabilitas]] yang tinggi. Tes ini didasarkan pada amplifikasi fragmen 986.

Keunggulan lain PCR tersarang adalah proses yang tidak memakan banyak waktu dibandingkan dengan proses lainnya, seperti teknik kultur biasa. Pada diagnosis penyakit tuberkulosis luar paru ini, dibandingkan efektivitas antara teknik PCR tersarang yang menargetkan [[gen]] MPB64 dari ''Mycobacterium tuberculosis'' dan teknik kultur pada media ''Lowenstein Jensen'' (LJ) medium. Percobaan ini melibatkan 400 [[sampel]] klinis yang diduga menderita tuberkulosis luar paru dan 30 [[spesimen]] kontrol nontuberkulosis yang kemudian dikultur dan dideteksi dengan PCR tersarang. Pada perbandingan hasil antara teknik kultur pada media LJ dengan PCR tersarang, hasil dari teknik kultur pada media LJ dari 400 spesimen [[klinis]] hanya 16 spesimen yang menunjukkan hasil positif. Pada hasil dari PCR tersarang, dari 400 spesimen klinis terdapat 141 hasil positif (35.2 %). Sedangkan, pada spesimen kontrol hasilnya negatif dengan PCR tersarang. Pada percobaan ini dapat dilihat bahwa PCR tersarang memiliki keakuratan dan sensitivitas yang tinggi, serta tidak memakan waktu, terlebih dibandingkan dengan metode [[kultur]] [[konvensional]].

== Referensi ==

== Sumber dan atribusi ==

Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Reaksi+berantai+polimerase+tersarang&oldid=29599865 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 29599865 (2026-08-19T10:40:41Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.