Informatika kimia: Perbedaan antara revisi
Impor teks terkontrol dari Wikipedia bahasa Indonesia; revisi 28954725; atribusi sumber disertakan. |
Presentation V4: sitasi, referensi, Math, Wikimedia Commons, dan atribusi |
||
| Baris 2: | Baris 2: | ||
== Sejarah == | == Sejarah == | ||
Istilah ''chemoinformatics'' didefinisikan oleh F. K. Brown pada tahun 1998 pada jurnal ''Current Opinion in Drug Discovery & Development'': | Istilah ''chemoinformatics'' didefinisikan oleh F. K. Brown<ref>F.K. Brown. ''Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery''. ''Annual Reports in Med. Chem''. 1998. Vol. 33. hlm. 375. doi:10.1016/S0065-7743(08)61100-8. ISBN 978-0-12-040533-6.</ref><ref>Brown, Frank. ''Editorial Opinion: Chemoinformatics–a ten year update''. ''Current Opinion in Drug Discovery & Development''. 2005. Vol. 8 (3). hlm. 296–302.</ref> pada tahun 1998 pada jurnal ''Current Opinion in Drug Discovery & Development'': | ||
<blockquote> | <blockquote> | ||
| Baris 9: | Baris 9: | ||
</blockquote> | </blockquote> | ||
Sejak saat itu, istilah ''chemoinformatics'' dan berkembang menjadi ''cheminformatics'' tetapi akademisi Eropa tetap menggunakan istilah ''chemoinformatics''. Diterbitkannya [[Journal of Cheminformatics]] menjadikan penggunaan istilah ''cheminformatics'' lebih populer. | Sejak saat itu, istilah ''chemoinformatics'' dan berkembang menjadi ''cheminformatics''<ref>[http://www.molinspiration.com/chemoinformatics.html Cheminformatics or Chemoinformatics ?]</ref> tetapi akademisi Eropa tetap menggunakan istilah ''chemoinformatics''.<ref>[http://infochim.u-strasbg.fr/chemoinformatics/Obernai%20Declaration.pdf Obernai Declaration].</ref> Diterbitkannya [[Journal of Cheminformatics]] menjadikan penggunaan istilah ''cheminformatics'' lebih populer. | ||
== Dasar ilmu == | == Dasar ilmu == | ||
Informatika kimia menggabungkan karya ilmiah di bidang [[kimia]], [[ilmu komputer]], dan [[ilmu informasi]] untuk berbagai bidang seperti [[topologi kimia]], [[teori grafik kimia]], [[perbaikan informasi]], dan [[penggalian data]] di bidang kimia. Informatika kimia juga bisa diaplikasikan pada analisis data pada berbagai industri seperti [[industri kertas]], [[industri pulp|pulp]], [[pewarna]], dan industri terkait. | Informatika kimia menggabungkan karya ilmiah di bidang [[kimia]], [[ilmu komputer]], dan [[ilmu informasi]] untuk berbagai bidang seperti [[topologi kimia]], [[teori grafik kimia]], [[perbaikan informasi]], dan [[penggalian data]] di bidang kimia.<ref>Gasteiger J.(Editor), Engel T.(Editor): ''Chemoinformatics: A Textbook''. John Wiley & Sons, 2004, ISBN 3-527-30681-1</ref><ref>A.R. Leach, V.J. Gillet: ''An Introduction to Chemoinformatics''. Springer, 2003, ISBN 1-4020-1347-7</ref><ref>Alexandre Varnek and Igor Baskin. ''Chemoinformatics as a Theoretical Chemistry Discipline''. ''Molecular Informatics''. 2011. Vol. 30 (1). hlm. 20–32.</ref> Informatika kimia juga bisa diaplikasikan pada analisis data pada berbagai industri seperti [[industri kertas]], [[industri pulp|pulp]], [[pewarna]], dan industri terkait. | ||
== Aplikasi == | == Aplikasi == | ||
=== Penyimpanan dan pemulihan data === | === Penyimpanan dan pemulihan data === | ||
Aplikasi utama dari informatika kimia adalah penyimpanan, indeksasi, dan pencarian informasi terkait senyawa atau campuran kimia yang dibutuhkan. Pencarian yang efisien bisa dilakukan dengan [[ilmu komputer]] [[penggalian data]], [[pemulihan informasi]], [[ekstraksi informasi]], dan [[pembelajaran mesin]]. | Aplikasi utama dari informatika kimia adalah penyimpanan, indeksasi, dan pencarian informasi terkait senyawa atau campuran kimia yang dibutuhkan. Pencarian yang efisien bisa dilakukan dengan [[ilmu komputer]] [[penggalian data]], [[pemulihan informasi]], [[ekstraksi informasi]], dan [[pembelajaran mesin]]. | ||
=== Perpustakaan virtual === | === Perpustakaan virtual === | ||
Data kimiawi bisa bersinggungan dengan molekul nyata atau virtual. Perpustakaan senyawa kimia virtual bisa dihasilkan dengan berbagai cara untuk menjelajahi ruang kimia dan menghasilkan hipotesis terkait senyawa baru dengan sifat yang diinginkan. Perpustakaan virtual yang mengklasifikasikan berbagai senyawa (obat-obatan, bahan alami, produk sintetik) telah dikembangkan menggunakan [[algoritme]] FOG (''fragment optimized growth''). | Data kimiawi bisa bersinggungan dengan molekul nyata atau virtual. Perpustakaan senyawa kimia virtual bisa dihasilkan dengan berbagai cara untuk menjelajahi ruang kimia dan menghasilkan hipotesis terkait senyawa baru dengan sifat yang diinginkan. Perpustakaan virtual yang mengklasifikasikan berbagai senyawa (obat-obatan, bahan alami, produk sintetik) telah dikembangkan menggunakan [[algoritme]] FOG (''fragment optimized growth'').<ref>Peter Kutchukian. ''FOG: Fragment Optimized Growth Algorithm for the de Novo Generation of Molecules occupying Druglike Chemical''. ''Journal of Chemical Information and Modeling''. 2009. Vol. 49 (7). hlm. 1630–1642. doi:10.1021/ci9000458.</ref> | ||
=== Penyaringan virtual === | === Penyaringan virtual === | ||
| Baris 35: | Baris 34: | ||
* [[Perusahaan farmasi]] | * [[Perusahaan farmasi]] | ||
* [[Statistika]] | * [[Statistika]] | ||
== Pranala luar == | == Pranala luar == | ||
* [http://icep.wikispaces.com Indiana Cheminformatics Education Portal] | * [http://icep.wikispaces.com Indiana Cheminformatics Education Portal] | ||
* [http://jcheminf.com Journal of Cheminformatics] | * [http://jcheminf.com Journal of Cheminformatics] | ||
* [https://www.collaborativedrug.com Collaborative Drug Discovery (CDD)] | * [https://www.collaborativedrug.com Collaborative Drug Discovery (CDD)] | ||
* [http://www.eyesopen.com/oechem-tk OEChem Cheminformatics Programming Toolkit] | * [http://www.eyesopen.com/oechem-tk OEChem Cheminformatics Programming Toolkit] | ||
* The [http://www.blueobelisk.org/ Blue Obelisk] Movement | * The [http://www.blueobelisk.org/ Blue Obelisk] Movement | ||
* The [http://www.echeminfo.com/ eCheminfo] Network and Community of Practice | * The [http://www.echeminfo.com/ eCheminfo] Network and Community of Practice | ||
* [http://djwild.info/ed Cheminformatics courses at Indiana University] | * [http://djwild.info/ed Cheminformatics courses at Indiana University] | ||
* [http://chemxseer.ist.psu.edu Chem<sub>X</sub>Seer search engine and tool at Penn State] | * [http://chemxseer.ist.psu.edu Chem<sub>X</sub>Seer search engine and tool at Penn State] | ||
* [http://reccr.chem.rpi.edu Cheminformatics at Rensselaer Polytechnic Institute] | * [http://reccr.chem.rpi.edu Cheminformatics at Rensselaer Polytechnic Institute] | ||
* [http://www.csa-trust.org The Chemical Structure Association Trust] (see also [[CSA Trust]]). | * [http://www.csa-trust.org The Chemical Structure Association Trust] (see also [[CSA Trust]]). | ||
* [http://www.cheminformatics.org Comprehensive cheminformatics link list and data set repository] | * [http://www.cheminformatics.org Comprehensive cheminformatics link list and data set repository] | ||
* [http://www.genomicglossaries.com/content/chemoinformatics_gloss.asp A cheminformatics glossary] | * [http://www.genomicglossaries.com/content/chemoinformatics_gloss.asp A cheminformatics glossary] | ||
* [http://moltable.ncl.res.in Chemoinformatics initiatives at NCL Pune, India] | * [http://moltable.ncl.res.in Chemoinformatics initiatives at NCL Pune, India] | ||
* [http://moltable.ncl.res.in/icci International Conference on Chemoinformatics at NCL,Pune] | * [http://moltable.ncl.res.in/icci International Conference on Chemoinformatics at NCL,Pune] | ||
* [http://vinodscaria.rnabiology.org/crowd-computing-for-cheminformatics-2013 Crowd Computing for Chemoinformatics at Vinod Scaria Lab, India] | * [http://vinodscaria.rnabiology.org/crowd-computing-for-cheminformatics-2013 Crowd Computing for Chemoinformatics at Vinod Scaria Lab, India] | ||
* [http://vinodscaria.rnabiology.org/cheminformatics-crowd-computing-for-tuberculosis Cheminformatics Crowd Computing for Tuberculosis Drug Discovery (3C4TB) Project Page] | * [http://vinodscaria.rnabiology.org/cheminformatics-crowd-computing-for-tuberculosis Cheminformatics Crowd Computing for Tuberculosis Drug Discovery (3C4TB) Project Page] | ||
* Famous [http://joelib.sourceforge.net/wiki/index.php/Cheminformatics_and_mining_quotation Cheminformatics quotations] | * Famous [http://joelib.sourceforge.net/wiki/index.php/Cheminformatics_and_mining_quotation Cheminformatics quotations] | ||
* [http://www.qsar.org The Cheminformatics and QSAR Society] | * [http://www.qsar.org The Cheminformatics and QSAR Society] | ||
* [http://www.ukqsar.org UK-QSAR and ChemoInformatics Group] | * [http://www.ukqsar.org UK-QSAR and ChemoInformatics Group] | ||
* [http://www.zbh.uni-hamburg.de/study/what_is_CI/index.php?language=en Education and Research at the University of Hamburg] | * [http://www.zbh.uni-hamburg.de/study/what_is_CI/index.php?language=en Education and Research at the University of Hamburg] | ||
* [http://www-ucc.ch.cam.ac.uk/ Cheminformatics research at the Unilever Centre for Molecular Informatics, Cambridge, UK] | * [http://www-ucc.ch.cam.ac.uk/ Cheminformatics research at the Unilever Centre for Molecular Informatics, Cambridge, UK] | ||
* [http://daniel.iut.univ-metz.fr/yachs YACHS Yet Another CHemistry Summarizer, Laboratoire Informatique d'Avignon LIA, France] | * [http://daniel.iut.univ-metz.fr/yachs YACHS Yet Another CHemistry Summarizer, Laboratoire Informatique d'Avignon LIA, France] | ||
* [http://www.novamechanics.com/ Cheminformatics research at NovaMechanics Cyprus] | * [http://www.novamechanics.com/ Cheminformatics research at NovaMechanics Cyprus] | ||
* [http://www.qspr.pe.kr/my/index.php?option=com_bookmarks&Itemid=28 Weblink-Cheminformatics SW and DB] | * [http://www.qspr.pe.kr/my/index.php?option=com_bookmarks&Itemid=28 Weblink-Cheminformatics SW and DB] | ||
| Baris 67: | Baris 63: | ||
* [http://www.igi-global.com/journal/international-journal-chemoinformatics-chemical-engineering/1176 International Journal of Chemoinformatics and Chemical Engineering] | * [http://www.igi-global.com/journal/international-journal-chemoinformatics-chemical-engineering/1176 International Journal of Chemoinformatics and Chemical Engineering] | ||
== Referensi == | |||
<references /> | |||
== Sumber dan atribusi == | == Sumber dan atribusi == | ||
Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Informatika+kimia&oldid=28954725 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 28954725 (2026-02-12T23:27:51Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku. | Konten artikel ini diadaptasi dari [https://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Informatika+kimia&oldid=28954725 Wikipedia bahasa Indonesia], revisi 28954725 (2026-02-12T23:27:51Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku. | ||
<!-- WIKI_UNISSULA_PRESENTATION_V4 --> | |||
Revisi terkini sejak 23 Agustus 2026 14.00
Informatika kimia (cheminformatics, chemoinformatics, chemical informatics) adalah penggunaan komputer dan metode informasional yang diaplikasikan pada masalah di bidang kimia. Contohnya aplikasi informatika kimia adalah pada bidang farmasi, yaitu penemuan obat. Informatika kimia juga digunakan untuk berbagai industri terkait seperti bioteknologi.
Sejarah
Istilah chemoinformatics didefinisikan oleh F. K. Brown[1][2] pada tahun 1998 pada jurnal Current Opinion in Drug Discovery & Development:
Chemoinformatics is the mixing of those information resources to transform data into information and information into knowledge for the intended purpose of making better decisions faster in the area of drug lead identification and optimization.
Informatika kimia adalah percampuran antara sumber daya informasi untuk mengubah data menjadi informasi dan informasi menjadi pengetahuan yang ditujukan untuk menjadikan pengambilan keputusan menjadi lebih baik di wilayah identifikasi dan optimisasi obat-obatan.
Sejak saat itu, istilah chemoinformatics dan berkembang menjadi cheminformatics[3] tetapi akademisi Eropa tetap menggunakan istilah chemoinformatics.[4] Diterbitkannya Journal of Cheminformatics menjadikan penggunaan istilah cheminformatics lebih populer.
Dasar ilmu
Informatika kimia menggabungkan karya ilmiah di bidang kimia, ilmu komputer, dan ilmu informasi untuk berbagai bidang seperti topologi kimia, teori grafik kimia, perbaikan informasi, dan penggalian data di bidang kimia.[5][6][7] Informatika kimia juga bisa diaplikasikan pada analisis data pada berbagai industri seperti industri kertas, pulp, pewarna, dan industri terkait.
Aplikasi
Penyimpanan dan pemulihan data
Aplikasi utama dari informatika kimia adalah penyimpanan, indeksasi, dan pencarian informasi terkait senyawa atau campuran kimia yang dibutuhkan. Pencarian yang efisien bisa dilakukan dengan ilmu komputer penggalian data, pemulihan informasi, ekstraksi informasi, dan pembelajaran mesin.
Perpustakaan virtual
Data kimiawi bisa bersinggungan dengan molekul nyata atau virtual. Perpustakaan senyawa kimia virtual bisa dihasilkan dengan berbagai cara untuk menjelajahi ruang kimia dan menghasilkan hipotesis terkait senyawa baru dengan sifat yang diinginkan. Perpustakaan virtual yang mengklasifikasikan berbagai senyawa (obat-obatan, bahan alami, produk sintetik) telah dikembangkan menggunakan algoritme FOG (fragment optimized growth).[8]
Penyaringan virtual
Penyaringan virtual melibatkan penyaringan secara komputaasional dengan perpustakaan senyawa kimia virtual dengan berbagai metode seperti docking, untuk mengidentifikasi anggota yang kemungkinan dapat memberikan sifat yang diinginkan. Dalam berbagai kasus, kimia kombinatorial digunakan untuk pengembangan perpustakaan untuk meningkatkan efisiensi penggalian data. Penyaringan senyawa kimia atau bahan alami berukuran molekul kecil juga sering dilakukan.
Lihat pula
- Bioinformatika
- Kimia komputasional
- Kimia kombinatorial
- Analisis data
- Chemometrics
- Kimia matematis
- Permodelan molekuler
- Perusahaan farmasi
- Statistika
Pranala luar
- Indiana Cheminformatics Education Portal
- Journal of Cheminformatics
- Collaborative Drug Discovery (CDD)
- OEChem Cheminformatics Programming Toolkit
- The Blue Obelisk Movement
- The eCheminfo Network and Community of Practice
- Cheminformatics courses at Indiana University
- ChemXSeer search engine and tool at Penn State
- Cheminformatics at Rensselaer Polytechnic Institute
- The Chemical Structure Association Trust (see also CSA Trust).
- Comprehensive cheminformatics link list and data set repository
- A cheminformatics glossary
- Chemoinformatics initiatives at NCL Pune, India
- International Conference on Chemoinformatics at NCL,Pune
- Crowd Computing for Chemoinformatics at Vinod Scaria Lab, India
- Cheminformatics Crowd Computing for Tuberculosis Drug Discovery (3C4TB) Project Page
- Famous Cheminformatics quotations
- The Cheminformatics and QSAR Society
- UK-QSAR and ChemoInformatics Group
- Education and Research at the University of Hamburg
- Cheminformatics research at the Unilever Centre for Molecular Informatics, Cambridge, UK
- YACHS Yet Another CHemistry Summarizer, Laboratoire Informatique d'Avignon LIA, France
- Cheminformatics research at NovaMechanics Cyprus
- Weblink-Cheminformatics SW and DB
- Cheminformatics studies from Unilever Centre for Molecular Informatics to OpenEye
- International Journal of Chemoinformatics and Chemical Engineering
Referensi
- ↑ F.K. Brown. Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery. Annual Reports in Med. Chem. 1998. Vol. 33. hlm. 375. doi:10.1016/S0065-7743(08)61100-8. ISBN 978-0-12-040533-6.
- ↑ Brown, Frank. Editorial Opinion: Chemoinformatics–a ten year update. Current Opinion in Drug Discovery & Development. 2005. Vol. 8 (3). hlm. 296–302.
- ↑ Cheminformatics or Chemoinformatics ?
- ↑ Obernai Declaration.
- ↑ Gasteiger J.(Editor), Engel T.(Editor): Chemoinformatics: A Textbook. John Wiley & Sons, 2004, ISBN 3-527-30681-1
- ↑ A.R. Leach, V.J. Gillet: An Introduction to Chemoinformatics. Springer, 2003, ISBN 1-4020-1347-7
- ↑ Alexandre Varnek and Igor Baskin. Chemoinformatics as a Theoretical Chemistry Discipline. Molecular Informatics. 2011. Vol. 30 (1). hlm. 20–32.
- ↑ Peter Kutchukian. FOG: Fragment Optimized Growth Algorithm for the de Novo Generation of Molecules occupying Druglike Chemical. Journal of Chemical Information and Modeling. 2009. Vol. 49 (7). hlm. 1630–1642. doi:10.1021/ci9000458.
Sumber dan atribusi
Konten artikel ini diadaptasi dari Wikipedia bahasa Indonesia, revisi 28954725 (2026-02-12T23:27:51Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.