KEGG

KEGG (singkatan dari Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) adalah kumpulan database yang berkaitan dengan genom, pathway biologi, penyakit, obat, dan bahan kimia. KEGG digunakan untuk riset dan pengajaran bioinformatika, termasuk analisis data dalam genomika, metagenomika, metabolomika dan studi omika lainnya, perancangan model dan simulasi dalam sistem biologi, serta riset translational dalam pengembangan obat.

Sejarah

Proyek database KEGG dimulai pada tahun 1995 oleh Minoru Kanehisa, Professor pada Institute for Chemical Research, Kyoto University, yang saat itu berada di bawah Human Genome Program Jepang.^[1]^[2] Menurut para developernya, KEGG merupakan suatu "computer representation" dari sistem biologi.^[3]

Informasi sistem
- PATHWAY—peta pathway untuk fungsi-fungsi seluler dan organismal
- MODULE—modul atau unit fungsional gen
- BRITE—klasifikasi hierarkis entiti biologi
Informasi genomik
- GENOME—genom lengkap
- GENES—gen dan protein dalam genom lengkap
- ORTHOLOGY—group ortologi gen dalam genom lengkap
Informasi kimia
- COMPOUND, GLYCAN—senyawa kimia dan glikan
- REACTION, RPAIR, RCLASS—reaksi kimia
- ENZYME—nomenklatur enzim
Informasi kesehatan
- DISEASE—penyakit manusia
- DRUG—obat yang sudah diberi izin
- ENVIRON—obat mentah dan bahan terkait kesehatan

Lihat pula

Comparative Toxicogenomics Database - CTDintegrates KEGG pathways with toxicogenomic and disease data
ConsensusPathDB, a molecular functional interaction database, integrating information from KEGG
Gene ontology
PubMed
Uniprot
Gene Disease Database

Pranala luar

Referensi

↑ Kanehisa M, Goto S. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Nucleic Acids Res. 2000. Vol. 28 (1). hlm. 27–30. doi:10.1093/nar/28.1.27.
↑ Kanehisa M. A database for post-genome analysis. Trends Genet. 1997. Vol. 13 (9). hlm. 375–6. doi:10.1016/S0168-9525(97)01223-7.
↑ Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M. From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG. Nucleic Acids Res. 2006. Vol. 34 (Database issue). hlm. D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102.

Sumber dan atribusi

Konten artikel ini diadaptasi dari Wikipedia bahasa Indonesia, revisi 28101760 (2025-10-18T07:07:15Z), yang tersedia berdasarkan lisensi Creative Commons Atribusi-BerbagiSerupa (CC BY-SA). Mohon gunakan konten ini secara bijak serta sesuai dengan ketentuan lisensi yang berlaku.

[1] Kanehisa M, Goto S. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. Nucleic Acids Res. 2000. Vol. 28 (1). hlm. 27–30. doi:10.1093/nar/28.1.27.

[2] Kanehisa M. A database for post-genome analysis. Trends Genet. 1997. Vol. 13 (9). hlm. 375–6. doi:10.1016/S0168-9525(97)01223-7.

[3] Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S, Katayama T, Araki M, Hirakawa M. From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG. Nucleic Acids Res. 2006. Vol. 34 (Database issue). hlm. D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102.

[1]

[2]

[3]